Genotyping of Histomonas meleagridis isolates based on Internal Transcribed Spacer-1 sequences

C-profiling is a novel genotyping method for protozoan pathogens, based on polymerase chain reaction and sequencing of AT-rich Internal Transcribed Spacer-1 sequences. It was applied to various Histomonas meleagridis isolates originating from outbreaks of histomoniasis in six Dutch turkey and chicken flocks. Three different H. meleagridis genotypes were identified. Type I and type II were associated with clinical disease. In two flocks, both having recovered from an outbreak of histomoniasis, a type III strain was found that was also morphologically slightly different from the type I and type II isolates. C-profiling is a promising technique to differentiate between H. meleagridis subtypes, making it useful for epidemiological studies. Génotypage des souches d' Histomonas meleagridis basé sur les séquences de l'espaceur-1 interne transcrit (ITS-1) Le C-profiling est une nouvelle méthode de génotypage pour les protozoaires pathogènes, basé sur le séquençage des séquences ITS-1 riche en AT. Cette méthode a été appliquée à différentes souches d' Histomonas meleagridis isolées de cas d'histomonose dans six troupeaux de dinde et de poulet aux Pays Bas. Trois différents génotypes d' H. meleagridis ont été identifiés. Les types I et II ont été associés à la maladie. Dans deux troupeaux guéris qui ont connu un épisode d'histomonose, une souche de type III a été mise en évidence qui était légèrement différente morphologiquement de celles des types I et II. Le C-profiling est une technique prometteuse pour différencier les sous types d' H. meleagridis et peut être utile pour les études épidémiologiques. Genotypisierung von Histomonas meleagridis -Isolaten basierend auf Internal Transcribed Spacer-1 (ITS-1) C-Profiling ist eine neue Genotypisierungsmethode für protozoale Krankheitserreger, die auf der PCR und der Sequenzierung von AT-reichen IST-1-Sequenzen beruht. Sie wurde hier bei zahlreichen Histomonas meleagridis -Isolaten durchgeführt, die von Histomonadose-Ausbrüchen in sechs niederländischen Puten- und Hühnerherden stammten. Es wurden drei verschiedene H. meleagridis -Genotypen identifiziert. Typ I und II waren mit klinischen Erkrankungen assoziiert. In zwei Herden, die einen Histomonadose-Ausbruch überstanden hatten, wurde ein Typ III-Stamm nachgewiesen, der sich auch morphologisch geringgradig von den Typ I- und II-Isolaten unterschied. Das C-Profiling ist eine vielversprechende Technik zur Unterscheidung von H. meleagridis- Subtypen in epidemiologischen Studien. Genotipificación de aislamientos de Histomonas meleagridis en base a secuencias del Espaciador-1 de Transcripción Interno (ITS-1) C-profiling es un nuevo método de genotipificación para patógenos protozoarios, basado en la PCR y secuenciación de secuencias ITS-1 ricas en AT. Se ha testado en varios aislamientos de Histomonas meleagridis procedentes de brotes de histomoniasis de seis lotes de pavos y pollos en Holanda. Se identificaron tres genotipos distintos de H. meleagridis . Los tipos I y II se asociaron con enfermedad clínica. Se encontró una cepa de tipo III, que también era morfológicamente algo distinta de los aislamientos de tipo I y II, en dos lotes que se habían recuperado de un brote de histomoniasis. C-profiling es una técnica prometedora para diferenciar los distintos subtipos de H. meleagridis , siendo de utilidad en estudios epidemiológicos.