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Transferability of wheat microsatellites to diploid Aegilops species and determination of chromosomal localizations of microsatellites in the S genome

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Overall, 253 genomic wheat (Triticum aestivum) microsatellite markers were studied for their transferability to the diploid species Aegilops speltoides, Aegilops longissima, and Aegilops searsii, representing the S genome. In total, 88% of all the analyzed primer pairs of markers derived from the B genome of hexaploid wheat amplified DNA fragments in the genomes of the studied species. The transferability of simple sequence repeat (SSR) markers of the T. aestivum A and D genomes totaled 74%. Triticum aestivum – Ae. speltoides, T. aestivum – Ae. longissima, and T. aestivum – Ae. searsii chromosome addition lines allowed us to determine the chromosomal localizations of 103 microsatellite markers in the Aegilops genomes. The majority of them were localized to homoeologous chromosomes in the genome of Aegilops. Several instances of nonhomoeologous localization of T. aestivum SSR markers in the Aegilops genome were considered to be either amplification of other loci or putative translocations. The results of microsatellite analysis were used to study phylogenetic relationships among the 3 species of the Sitopsis section (Ae. speltoides, Ae. longissima, and Ae. searsii) and T. aestivum. The dendrogram obtained generally reflects the current views on phylogenetic relationships among these species.Key words: Triticum aestivum, Aegilops speltoides, Aegilops longissima, Aegilops searsii, microsatellite, SSR, chromosome addition lines, phylogeny.

L'utilité de 253 microsatellites génomiques du blé chez les espèces diploïdes Aegilops speltoides, Aegilops longissima, et Aegilops searsii, 3 espèces à génome S, a été vérifiée. Au total, 88 % des paires d'amorces analysées provenant du génome B du blé hexaploïde (Triticum aestivum) ont produit des amplicons chez les génomes des espèces étudiées. Similairement, ce sont 74 % des microsatellites des génomes A et D du T. aestivum qui ont amplifié chez ces mêmes espèces. Des lignées d'addition T. aestivum – Ae. speltoides, T. aestivum – Ae. longissima, et T. aestivum – Ae. searsii ont permis de déterminer la position chromosomique des 103 marqueurs dans les génomes des Aegilops. La majorité de ceux-ci étaient situés à un emplacement homéologue chez les Aegilops. Plusieurs cas de localization nonhoméologue des microsatellites du T. aestivum chez le génome des Aegilops résultaient soit de l'amplification d'autres locus ou de possibles translocations. Les résultats de ces analyses de microsatellites ont été utilizés pour étudier les relations phylogénétiques parmi les 3 espèces de la section Sitopsis (Ae. speltoides, Ae. longissima, et Ae. searsii) et le T. aestivum. Le dendrogramme ainsi obtenu est généralement fidèle à l'idée que l'on a présentement des relations phylogénétiques entre ces espèces.Mots clés : Triticum aestivum, Aegilops speltoides, Aegilops longissima et Aegilops searsii, microsatellite, lignées d'addition chromosomiques, phylogénie.[Traduit par la Rédaction]
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Document Type: Research Article

Publication date: December 1, 2005

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