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Steps towards a repertoire of comprehensive maps of human protein interaction networks: the Human Proteotheque Initiative (HuPI)

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Defining human protein interaction networks has become essential to develop an overall, systems-based understanding of the molecular events that sustain cell growth in normal and disease conditions. To characterize protein interaction networks from human cells, we have undertaken the development of a systematic, unbiased technology pipeline that couples experimental and computational approaches. This discovery engine is central to the Human Proteotheque Initiative (HuPI), a multidisciplinary project aimed at building a repertoire of comprehensive maps of human protein interaction networks, the Human Proteotheque. The information contained in the Proteotheque is made publicly available through an interactive web site that can be consulted to visualize some of the fundamental molecular connections formed in human cells and to determine putative functions of previously uncharacterized proteins based on guilt by association. The process governing the evolution of HuPI towards becoming a repository of accurate and complete protein interaction maps is described.

La définition des réseaux d’interactions protéiques est devenue essentielle pour acquérir des connaissances globales basées sur les systèmes des événements moléculaires qui sous-tendent la croissance cellulaire dans des conditions normales et pathologiques. Afin de caractériser les réseaux d’interactions protéiques des cellules humaines, nous avons entrepris de développer un pipeline technologique systématique et non biaisé qui couple des approches expérimentales et informatiques. Ce « moteur de découverte » est essentiel à la Human Proteotheque Initiative (HuPI), un projet multidisciplinaire ayant pour but de construire un répertoire de cartes complètes des réseaux d’interactions protéiques, la Protéothèque humaine. L’information présente dans la protéothèque est disponible au public grâce à un site Web interactif qui peut être consulté pour visualiser quelques-unes des connexions moléculaires fondamentales formées dans les cellules humaines et déduire des fonctions présumées de protéines nouvelles non caractérisées, « coupables par association ». Le processus qui régit l’évolution de la HuPI vers la définition fiable et complète de cartes d’interactions protéiques est décrit.
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Document Type: Research Article

Publication date: April 1, 2008

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