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Recent developments in mass spectrometry-based quantitative phosphoproteomics

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Protein phosphorylation is a reversible post-translational modification that is involved in virtually all eukaryotic cellular processes and has been studied in great detail in recent years. Many developments in mass spectrometry (MS)-based proteomics have been successfully applied to study protein phosphorylation in highly complicated samples. Furthermore, the emergence of a variety of enrichment strategies has allowed some of the challenges associated with low phosphorylation stoichiometry and phosphopeptide copy number to be overcome. The dynamic nature of protein phosphorylation complicates its analysis; however, a number of methods have been developed to successfully quantitate phosphorylation changes in a variety of cellular systems. The following review details some of the most recent breakthroughs in the study of protein phosphorylation, or phosphoproteomics, using MS-based approaches. The majority of the focus is placed on detailing strategies that are currently used to conduct MS-based quantitative phosphoproteomics.

La phosphorylation des protéines est une modification post-transcriptionnelle impliquée dans quasiment tous les processus cellulaires eucaryotes et qui a été étudiée en détail au cours des dernières années. Plusieurs développements de la spectrométrie de masse appliquée à la protéomique ont été utilisés avec succès pour étudier la phosphorylation d’échantillons protéiques hautement complexes. Qui plus est, l’émergence d’une variété de stratégies d’enrichissement a permis de relever les défis associés à une stoechiométrie de phosphorylation et à un nombre de copies de phosphopeptides faibles. La nature dynamique de la phosphorylation des protéines complique son analyse; cependant, un certain nombre de méthodes ont été mises au point pour quantifier adéquatement les changements de phosphorylation dans divers systèmes cellulaires. L’article de revue suivant détaille quelques-unes des découvertes les plus récentes du domaine de la phosphorylation des protéines, ou phosphoprotéomique, qui utilisent des approches basées sur la spectrométrie de masse. L’emphase sera mise sur la description détaillée des stratégies utilisées couramment dans la phosphoprotéomique quantitative basée sur la spectrométrie de masse.
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Document Type: Research Article

Publication date: April 1, 2008

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