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Analysis of two Chinese yak (Bos grunniens) populations using bovine microsatellite primers

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Summary Two Chinese domestic yak populations representing the Plateau type and the Huanhu Alpine type were analysed with 12 bovine microsatellite primers. All primer pairs functioned in the yak genome and polymorphism was found at all loci. The allele size ranges and frequencies of the two yak populations were similar and there was considerable overlap with the allele size ranges observed in cattle. Data for European cattle breeds was obtained from the Cattle Diversity Database (CaDBase) to interpret the heterozygosity and genetic distance estimates in yak populations. Heterozygosity estimated for the two yak populations was comparable with that of European cattle while Nei's Genetic Distance between the two yak populations was less than distances between the most closely related German cattle breeds. Bovine microsatellite primers proved to be a valuable tool for characterization of yak populations.

German
Zusammenfassung Untersuchungen von zwei chinesischen Yak (Bos grunniens) Herden mittels Primersequenzen von Rindermikrosatelliten

Primersequenzen von Rindermikrosatelliten wurden verwendet, um zwei chinesische Yak-Herden zu analysieren, eine vom Plateau-Typ und eine andere vom Huanhu-Bergtyp. Alle 12 Primerpaare führten zu polymorphen Amplifikationsprodukten mit den DNA-Proben der Yaks. Der Allelgrößenbereich und die Allelfrequenzen aller 12 Marker waren in den beiden Yak-Herden sehr ähnlich. Zum Vergleich wurden Typisierungsergebnisse der 12 Mikrosatellitengenorte von 15 europäischen Rinderassen aus der Rinderdiversitätsdatenbank CaDBase entnommen. Ein großer Teil der Yak-Allele hatte die gleiche Größe wie beim Rind und auch der geschätzte Heterozygotiegrad der beiden Yak-Populationen war vergleichbar mit dem durchschnittlichen Heterozygotiegrad der 15 Rinderrassen. Die genetische Distanz (Nei's D A ) zwischen beiden Yak-Herden wurde jedoch geringer geschätzt als zwischen zwei Paaren eng verwandter Rinderrassen. Die Ergebnisse zeigen, dass Sequenzinformationen von Rindermikrosatellitenprimern für die Charakterisierung von Yak-Populationen auf der molekularen Ebene nützlich sein können.
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Document Type: Research Article

Affiliations: 1: College of Chemical Engineering and Technology, Biological Science, Biological Engineering, Applied Chemistry, Yantai University, P. R. China, 2: Institute for Animal Science, Mariensee (FAL), Germany, 3: Lanzhou Institute of Animal Science and Pharmaceutic, Chinese Academy of Agricultural Sciences, P. R. China

Publication date: August 1, 2003

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