Authors: Hong, Min J.; Kim, Dae Y.e.o.n.; Kim, Jae Y.o.o.n.; Heo, Hwa Y.o.u.n.g.; Kim, Tae H.o.; Jang, Cheol S.e.o.n.g.; Seo, Yong W.e.o.n.; Jung, Je H.y.e.o.n.g.

Source: Genome, Volume 51, Number 10, October 2008 , pp. 856-869(14)

Publisher: NRC Research Press

Abstract:

Enzymatic methylation, which is catalyzed by the large number of O-methyltransferases (OMTs), is one of the important reactions in the flow of primary and (or) secondary metabolism. In a previous study, the gene TaOMT1 was induced by Hessian fly infestation of a wheat-rye translocation line. In this study we considered other wheat OMT genes - TaOMT3, TaOMT4, and TaOMT5 - using a bioinformatics approach and examined the TaOMT genes for their genomic organization, tissue-specific expression, responses to abiotic stresses and hormones, and cis-elements. There appeared to be a homoeologous relationship between TaOMT4 (6DS) and TaOMT5 (6BS), whereas TaOMT1 and TaOMT3 were placed on chromosome arms 7BL and 5DL, respectively. Differences in the tissue-specific, constitutive, and stress-inducible expression patterns among the TaOMT genes were found in both healthy and stressed plants. A number of cis-elements, which are potentially correlated with the responses of the TaOMT genes, were detected in the analysis of the TaOMT promoter sequences. In addition, evolutionary perspectives of the TaOMT genes are discussed. The nucleotide sequences have been deposited in the GenBank database under accession Nos. AAP23942 (TaCOMT1), EF423610 (TaOMT5), EF423611 (TaOMT4), EF423612 (TaOMT3), EU831287 (5′ upstream of TaOMT1), EU831288 (5′ upstream of TaOMT3), EU831289 (5′ upstream of TaOMT4), and EU831290 (5′ upstream of TaOMT5).

La méthylation enzymatique, catalysée par un grand nombre d'O-méthyltransférases (OMT), constitue l'une des réactions importantes au sein des métabolismes primaire et secondaire. Au cours d'un travail antérieur, le gène codant pour la TaOMT1 a été induit par infestation larvaire avec la mouche de Hesse chez une lignée de translocation blé-seigle. Dans le présent travail, les auteurs ont examiné d'autres gènes d'OMT du blé, TaOMT3, TaOMT4 et TaOMT5, au moyen d'une approche bioinformatique et ils ont caractérisé l'organisation génomique, l'expression tissus-spécifique, la réponse aux stress abiotiques et aux hormones de ces gènes ainsi que les éléments cis présents chez ceux-ci. Il semble exister une relation d'homéologie entre TaOMT4 (6DS) et TaOMT5 (6BS), tandis que les gènes TaOMT1 et TaOMT3 sont respectivement situés sur 7BL et 5DL. Des différences quant à l'expression de ces gènes dans différents tissus ainsi que la nature constitutive ou inductible de leur expression en réponse aux stress ont été notées tant chez des plantes saines que traitées. Plusieurs éléments cis potentiellement impliqués dans les réponses des gènes TaOMT ont été détectés lors de l'analyse des promoteurs et du type d'expression de chacun de ces gènes. De plus, les auteurs discutent des perspectives évolutives des gènes TaOMT. Les séquences nucléotidiques ont été déposées dans GenBank et portent les numéros d'accession suivants : AAP23942 (TaCOMT1), EF423610 (TaOMT5), EF423611 (TaOMT4), EF423612 (TaOMT3), EU831287 (5′ en amont de TaOMT1), EU831288 (5′ en amont de TaOMT3), EU831289 (5′ en amont de TaOMT4) et EU831290 (5′ en amont de TaOMT5).

Document Type: Research article

Publication date: 2008-10-01

More about this publication?

• From its inception in 1957, this international cytogenetics journal has catered to the research areas of the members of the Genetics Society of Canada; traditionally, these have included agriculture, entomology, genetics/cytogenetics, and evolutionary mechanisms. The contents of the journal have evolved as contributors developed new technologies and interests. A 20-member Editorial Board is composed of scientists from around the world. Reviews and commentary from respected experts are often featured.
• Information for Authors
• Submit a Paper
• Subscribe to this Title
• Terms & Conditions
• Sample Issue
• Reprints & Permissions
• ingentaconnect is not responsible for the content or availability of external websites

Related content

• In this: publication
• By this: publisher
• In this Subject: Biology ,  Genetics
• By this author: Hong, Min J. ;  Kim, Dae Y.e.o.n. ;  Kim, Jae Y.o.o.n. ;  Heo, Hwa Y.o.u.n.g. ;  Kim, Tae H.o. ;  Jang, Cheol S.e.o.n.g. ;  Seo, Yong W.e.o.n. ;  Jung, Je H.y.e.o.n.g.

Website © Publishing Technology. Article copyright remains with the publisher, society or author(s) as specified within the article.

• Terms and conditions
• Privacy policy
• Information for advertisers