Skip to main content

Differential duplication of an intronic region in the NFATC1 gene in patients with congenital heart disease

Buy Article:

$50.00 plus tax (Refund Policy)

Abstract:

Most forms of congenital heart disease (CHD) result from aberrations in cardiac morphogenesis including errors in septation, valve formation, and proper patterning of the great vessels. Transcription factors are key proteins that dictate mRNA synthesis rate and subsequent protein production in most eukaryotes. NFATC1 belongs to the Rel family of transcription factors. In mice, it is expressed in the embryonic heart and is restricted to the endocardium where it plays a major role in valve formation. To establish a role for NFATC1 in CHD, we started screening for mutations in the exons encoding the DNA-binding domain of NFATC1 in patients enrolled in our study on CHD in Lebanon. DNA was extracted from patients with pulmonary stenosis (PS), tricuspid atresia (TA) and ventricular septal defect (VSD). PCR amplification and DNA sequencing were done on the patients and their parents and (or) siblings. PCR amplification of the exon 7 region showed that 2 bands are obtained in 57% of patients with CHD (32/56) and in 45% of their healthy parents and (or) siblings. Sequencing of the 2 bands revealed that both are amplicons of the exon 7 region, and that the additional band harbors an additional 44 nucleotides segment in the intronic region. The homozygous form of this allele was only present in patients with VSD (2/21). A screen of a pool of 81 healthy, unrelated individuals showed no presence for the homozygous form of this allele, suggesting that NFATC1 is a potential VSD-susceptibility gene.

Les malformations congénitales cardiaques sont causées par des aberrations touchant la morphogenèse du cœur et ce à plusieurs niveaux : les septa, les valves, et les vaisseaux. Les facteurs de transcription ont un rôle clé dans la morphogenèse cardiaque : ce sont des protéines qui règlent la synthèse de l’ARNm de leurs gènes cibles chez tous les eucaryotes. NFATC1 fait partie de la famille Rel des facteurs de transcription : les études chez les mammifères ont permis de démontrer que ce facteur est exprimé dans le cœur embryonnaire. De plus, l’inactivation de ce gène chez la souris conduit à une létalité embryonnaire due à des malformations cardiaques touchant spécifiquement les valves. Pour essayer de démontrer un rôle prépondérant pour NFATC1 dans les maladies congénitales cardiaques, nous avons commencé à cribler pour des mutations de ce gène chez des patients avec formes multiples de malformations cardiaques au Liban. L’ ADN génomique a été extrait du sang des patients ainsi que celui de leurs parents et (ou) frères et sœurs après leur consentement écrit. L’amplification par PCR de l’ exon 7 en particulier qui code pour une partie de la région fonctionnelle de NFATC1 a montré l’existence de deux bandes chez 57 % des patients (32/56) et 45 % des parents, frères, et sœurs. Le séquençage de ces 2 bandes amplifiées a permis de confirmer l’existence de 2 allèles, l’un correspondant à la séquence publiée et l’autre incluant une région de 44 nucléotides en plus dans la région intronique. Le génotypage de tous les patients et de 81 sujets normaux a montré que seuls 2 patients avec défaut de formation du septum ventriculaire (VSD) ont la forme homozygote de cet al.lèle suggérant que NFATC1 pourrait être un gène de susceptibilité pour VSD.

Document Type: Research Article

Publication date: 2006-09-01

More about this publication?
  • From its inception in 1957, this international cytogenetics journal has catered to the research areas of the members of the Genetics Society of Canada; traditionally, these have included agriculture, entomology, genetics/cytogenetics, and evolutionary mechanisms. The contents of the journal have evolved as contributors developed new technologies and interests. A 20-member Editorial Board is composed of scientists from around the world. Reviews and commentary from respected experts are often featured.
  • Information for Authors
  • Submit a Paper
  • Subscribe to this Title
  • Terms & Conditions
  • Sample Issue
  • Reprints & Permissions
  • Ingenta Connect is not responsible for the content or availability of external websites
  • Access Key
  • Free content
  • Partial Free content
  • New content
  • Open access content
  • Partial Open access content
  • Subscribed content
  • Partial Subscribed content
  • Free trial content
Cookie Policy
X
Cookie Policy
Ingenta Connect website makes use of cookies so as to keep track of data that you have filled in. I am Happy with this Find out more