Genetic diversity among silkworm (Bombyx mori L., Lep., Bombycidae) germplasms revealed by microsatellites

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Abstract:

To determine genetic relationships among strains of silkworm, Bombyx mori L., 31 strains with different origins, number of generations per year, number of molts per generation, and morphological characters were studied using simple sequence repeat (SSR) markers. Twenty-six primer pairs flanking microsatellite sequences in the silkworm genome were assayed. All were polymorphic and unambiguously separated silkworm strains from each other. A total of 188 alleles were detected with a mean value of 7.2 alleles/locus (range 2–17). The average heterozygosity value for each SSR locus ranged from 0 to 0.60, and the highest one was 0.96 (Fl0516 in 4013). The mean polymorphism index content (PIC) was 0.66 (range 0.12–0.89). Unweighted pair group method with arithmetic means (UPGMA) cluster analysis of Nei's genetic distance grouped silkworm strains based on their origin. Seven major ecotypic silkworm groups were analyzed. Principal components analysis (PCA) for SSR data support their UPGMA clustering. The results indicated that SSR markers are an efficient tool for fingerprinting cultivars and conducting genetic-diversity studies in the silkworm.Key words: silkworm, Bombyx mori L., microsatellites, simple sequence repeat (SSR), genetic diversity.

Afin d'identifier les relations génétiques entre diverses souches du ver à soie, Bombyx mori L., 31 souches différant quant à leur origine, au nombre de générations/année, au nombre de mues par génération et présentant des caractères morphologiques différents ont été étudiées à l'aide de marqueurs SSR. Vingt-six paires d'amorces bordant des microsatellites dans le génome du ver à soie ont été employées. Toutes ont révélé du polymorphisme et ont permis de distinguer les souches les unes des autres de manière claire. Au total, 188 allèles ont été détectés, soit une moyenne de 7,2 allèles/locus (entre 2 et 17). L'hétérozygotie moyenne pour les locus SSR variait entre 0 et 0,60, alors que la valeur la plus élevée atteignait 0,96 (F10516 chez 4013). L'indice de polymorphisme (PIC) moyen était de 0,66 (entre 0,12 et 0,89). Une analyse de groupement UPGMA des distances génétiques de Nei a permis de grouper les souches sur la base de leur origine. Sept groupes écotypiques majeurs ont été analysés. Une analyse en composantes principales (PCA) des données SSR est venue appuyer les résultats de l'analyse UPGMA. Les résultats indiquent que les marqueurs SSR constituent un outil efficace pour l'obtention d'empreintes génétiques et la réalisation d'études sur la diversité génétique chez le ver à soie.Mots clés : ver à soie, Bombyx mori L., microsatellites, SSR, diversité génétique.[Traduit par la Rédaction]

Document Type: Research Article

Publication date: October 1, 2005

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