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A new karyological variant of Oecomys (Rodentia: Sigmodontinae) and its phylogenetic relationship based on molecular data

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Abstract:

A new karyological variant of the Sigmodontinae genus Oecomys was detected in specimens from Brazilian Pantanal. Karyologic analyses showed 2n = 72 and FN = 90, which differs from all known chromosomal complements of the genus. This new karyomorph showed distinctive morphological attributes and could not be attributed to any described Oecomys species. Molecular analysis using cytochrome-b sequence data suggested the monophyly of Oecomys. Maximum-likelihood analyses placed the Oecomys sp. haplotype clade as the sister branch to Oecomys bicolor, whereas maximum-parsimony analyses did not resolve its relationship with the other Oecomys species. Kimura's two parameters distance estimates between this and other Oecomys species are high, and active gene flow has been found not to coexist with these divergence estimates.Key words: Oecomys sp., rodent, Sigmodontinae, karyotype, molecular phylogeny.

Un nouveau variant caryotypique au sein du genre Oecomys, lequel appartient aux sigmodontinés, a été détecté chez des spécimens du Pantanal brésilien. Des analyses caryotypiques ont montré que chez ce groupe 2n = 72 et que FN = 90, des caractéristiques distinguant le caryotype au sein de ce groupe de tous les autres compléments chromosomiques connus au sein de ce genre. Ce nouveau caryotype possédait des attributs morphologiques distinctifs et il ne pouvait être attribué à aucune des espèces connues d'Oecomys. Une analyse moléculaire réalisée sur la séquence du gène codant pour la cytochrome-b a suggéré une origine monophylétique chez les Oecomys. Des analyses de vraisemblance maximale ont placé le clade des Oecomys sp. comme une branche sœur de l'Oecomys bicolor tandis que des analyses de parcimonie n'ont pas permis de révéler les relations avec les autres espèces du genre Oecomys. Les estimés de distance à deux paramètres de Kimura entre l'Oecomys sp. et les autres espèces d'Oecomys étaient élevées et il a été trouvé que les flux géniques ne pouvaient co-exister avec ces estimations de la divergence.Mots clés : Oecomys sp., rongeurs, sigmodontinés, caryotype, phylogénie moléculaire.[Traduit par la Rédaction]

Document Type: Research Article

Publication date: April 1, 2003

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