Molecular systematics of the genus Sigmodon: results from mitochondrial and nuclear gene sequences

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Abstract:

Phylogenetic relationships within the genus Sigmodon Say and Ord, 1825 were examined using sequence data from multiple gene regions, including exon 1 of the nuclear-encoded interphotoreceptor retinoid binding protein, intron 7 of the nuclear beta-fibrinogen gene, and the mitochondrial cytochrome b gene from 27 individuals representing 11 species of Sigmodon. Nuclear genes were analyzed independently, combined with each other, and combined with the mitochondrial data. Topologies were constructed using parsimony and Bayesian methods, with nodal support provided by bootstrap and posterior probability values. All analyses recovered four independent clades (I-IV), each representing unique species groups: hispidus, fulviventer, peruanus, and alstoni. The analyses from the combined data also provided support for relationships previously proposed within those species groups.

Nous avons déterminé les relations phylogénétiques au sein du genre Sigmodon Say et Ord, 1825 à l’aide de données de séquençage de plusieurs régions géniques, y compris l’exon 1 de la protéine de liaison à l’interphotorécepteur rétinoïde nucléaire, l’intron 7 du gène nucléaire du bêta-fibrinogène et le gène mitochondrial du cytochrome b chez 27 individus représentant 11 espèces de Sigmodon. Les gènes nucléaires ont été analysés séparément, puis combinés l’un à l’autre et enfin associés aux données mitochondriales. Nous avons construit des typologies à l’aide de méthodes de parcimonie et de méthodes bayésiennes et obtenu l’appui nodal par bootstrap et les valeurs de probabilité a posteriori. Toutes les analyses mettent en évidence quatre clades (I-IV) indépendants, chacun représentant un groupe particulier d’espèces, hispidus, fulviventer, peruanus et alstoni. Les analyses faites sur l’ensemble des données combinées appuient les relations proposées antérieurement pour ces groupes d’espèces.

Document Type: Research Article

Publication date: March 1, 2009

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