Skip to main content

Genetic structure of raccoons in eastern North America based on mtDNA: implications for subspecies designation and rabies disease dynamics

Buy Article:

$50.00 plus tax (Refund Policy)

Abstract:

Subspecific designations are useful for wildlife management when they represent real barriers to gene flow. In this study, we assess genetic partitioning of mitochondrial DNA control region variation to determine if the structuring is congruent with morphologically defined subspecies of the common raccoon (Procyon lotor (L., 1758)). Mitochondrial control region sequences were analyzed within and among four subspecies (Procyon lotor elucus Bangs, 1898, Procyon lotor lotor (L., 1758), Procyon lotor hirtus Nelson and Goldman, 1930, and Procyon lotor varius Nelson and Goldman, 1930) that occur along the eastern seaboard of North America through to the central United States. This identified 76 haplotypes, 59 of which were specific to one of the four ranges, while only 1 haplotype was wide-spread. Phylogenetic analysis revealed three distinct lineages: one found primarily in Florida, one along the eastern seaboard, and the third predominantly to the west of the Mississippi River. These lineages likely diverged during the Pleistocene, as a result of rising sea levels creating barriers to gene flow. The range of P. l. elucus is still primarily one lineage supporting the subspecific designation; however, there is considerable lineage mixing across the ranges of P. l. hirtus, P. l. lotor, and P. l. varius, suggesting that they be synonymized to P. l. lotor. While some of these subspecies designations are not supported, we have found that landscape attributes affect gene flow, which can be of use in informing rabies management.

Les désignations de sous-espèces sont utiles pour l’aménagement de la faune lorsqu’elle représentent de véritables barrières au flux génique. Dans notre étude, nous évaluons le partitionnement génétique de la variation de la région de contrôle de l’ADN mitochondrial afin de voir s’il s’accorde avec les sous-espèces du raton laveur (Procyon lotor (L., 1758)) définies d’après des critères morphologiques. Nous avons analysé les séquences de la région de contrôle mitochondriale au sein de quatre sous-espèces et entre ces sous-espèces; ce sont Procyon lotor elucus Bangs, 1898, Procyon lotor lotor (L., 1758), Procyon lotor hirtus Nelson et Goldman, 1930 et Procyon lotor varius Nelson et Goldman, 1930 qui se retrouvent sur la côte est de l’Amérique du Nord jusqu’au centre des États-Unis. Nous avons identifié 76 haplotypes, dont 59 sont spécifiques à l’une des quatre aires de répartition géographique et un seul haplotype largement répandu. Une analyse phylogénétique révèle l’existence de trois lignées distinctes : une trouvée surtout en Floride, une seconde le long de la côte est et la troisième principalement à l’ouest du Mississippi. Ces lignées ont vraisemblablement divergé durant le pléistocène lorsque la montée des niveaux de la mer ont créé des barrières au flux génique. La répartition de P. l. elucus correspond en gros à une seule lignée, ce qui appuie la désignation de cette sous-espèce; il y a, cependant, un important mélange des lignées au sein des répartitions des sous-espèces P. l. hirtus, P. l. lotor et P. l. varius, ce qui nous amène à suggérer qu’elles soient considérées comme des synonymes de P. l. lotor. Bien que nos résultats n’appuient pas la reconnaissance de certaines de ces sous-espèces, nous avons trouvé des caractéristiques du paysage qui affectent le flux génique qui pourraient être d’intérêt pour la gestion de la rage.

Document Type: Research Article

Publication date: 2008-09-01

More about this publication?
  • Published since 1929, this monthly journal reports on primary research contributed by respected international scientists in the broad field of zoology, including behaviour, biochemistry and physiology, developmental biology, ecology, genetics, morphology and ultrastructure, parasitology and pathology, and systematics and evolution. It also invites experts to submit review articles on topics of current interest.
  • Information for Authors
  • Submit a Paper
  • Subscribe to this Title
  • Terms & Conditions
  • Sample Issue
  • Reprints & Permissions
  • Ingenta Connect is not responsible for the content or availability of external websites
  • Access Key
  • Free content
  • Partial Free content
  • New content
  • Open access content
  • Partial Open access content
  • Subscribed content
  • Partial Subscribed content
  • Free trial content
Cookie Policy
X
Cookie Policy
Ingenta Connect website makes use of cookies so as to keep track of data that you have filled in. I am Happy with this Find out more