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Phylogeny of the East Asian cyprinids inferred from sequences of the mitochondrial DNA control region

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With 210 genera and 2010 species, Cyprinidae is the largest freshwater fish family in the world. Several papers, based on morphological and molecular data, have been published and have led to some solid conclusions, such as the close relationships between North American phoxinins and European leuciscins. However, the relationships among major subgroups of this family are still not well resolved, especially for those East Asian groups. In the present paper, the mitochondrial DNA (mtDNA) control region, 896–956 base pairs, of 17 representative species of East Asian cyprinids was sequenced and compared with those of 21 other cyprinids to study their phylogenetic relationships. After alignment, there were 1051 sites. The comparison between pairwise substitutions and HKY distances showed that the mtDNA control region was suitable for phylogenetic study. Phylogenetic analysis indicated that there are two principal lineages in Cyprinidae: Cyprinine and Leuciscine. In Cyprinine, the relationships could be a basal Labeoinae, an intermediate Cyprininae, and a diversified Barbinae (including Schizothroaxinae). In Leuciscine, Rasborinae is at the basal position; Gobioninae and Leuciscinae are sister groups; the East Asian cultrin–xenocyprinin taxa form a large mono phyl etic group with some small affiliated groups; and the positions of Acheilognathinae and Tincinae are still uncertain.

Avec leurs 210 genres et 2010 espèces, les cyprinidés constituent la famille de poissons d'eau douce la plus importante au monde. Il existe plusieurs études, basées sur des données morphologiques et moléculaires, qui sont arrivées à des conclusions phylogénétiques solides, telle que la proche parenté entre les phoxininés d'Amérique du Nord et les leuciscinés d'Europe. Cependant les relations entre les autres sous-groupes principaux de la famille sont encore mal définies, particulièrement entre les groupes de l'Asie de l'Est. Dans notre étude, nous avons séquencé la région de contrôle de l'ADN mitochondrial (ADNmt), de 896 à 956 paire de bases, chez 17 espèces caractéristiques des cyprinidés de l'Asie de l'Est et comparé nos résultats à ceux obtenus chez 21 autres espèces de cyprinidés afin de mettre en lumière les relations phylogénitiques. Une fois les alignements faits, il y a 1051 sites. La comparaison entre les sub stitutions de paires et les distances HKY montre que la région de contrôle de l'ADNmt peut servir à une étude phylogénétique. L'analyse phylogénétique indique l'existence de deux lignées principales chez les cyprinidés : les cyprinines et les leuciscines. Chez les cyprinines, les relations incluent les labéoninés ancestraux, un groupe intermédiaire de cyprininés et le groupe diversifié des barbinés (incluant les schizothroaxinés). Chez les leuciscines, les rasborinés constituent le groupe ancestral; les gobioninés et les leuciscinés sont des groupes soeurs; les taxons des cultrinés–xéocyprininés de l'Asie de l'Est forment un grand ensemble monophylétique qui inclut de petits groupes affiliés; la position des acheilognathinés et celle des tincinés restent à déterminer.[Traduit par la Rédaction]

Document Type: Research Article

Publication date: 2003-12-01

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  • Published since 1929, this monthly journal reports on primary research contributed by respected international scientists in the broad field of zoology, including behaviour, biochemistry and physiology, developmental biology, ecology, genetics, morphology and ultrastructure, parasitology and pathology, and systematics and evolution. It also invites experts to submit review articles on topics of current interest.
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