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mRNA analysis in flattened fauna: obtaining gene-sequence information from road-kill and game-hunting samples

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Abstract:

Whether gene-sequence information could be obtained using mRNA from road-kill and hunting samples was investigated. Adipose tissue was used to clone cDNA fragments of the hormone leptin and brain tissue was used for the enzyme glutamic acid decarboxylase (GAD). Tissues collected from road-killed animals were used to clone leptin from RNA samples of raccoon (Procyon lotor) and woodchuck (Marmota monax). We were able to extract RNA and clone GAD67 from samples of masked shrew (Sorex cinereus), although the time of death was unknown. We collaborated with hunters who provided tissues from which we cloned leptin and GAD isoforms from beaver (Castor canadensis), red squirrel (Tamiasciurus hudsonicus), black bear (Ursus americanus), and moose (Alces alces americana). Molecular phylogenetic analyses confirmed that the sequences obtained did not result from contamination. A time-course experiment showed that even 24 h after the death of rats, sufficient mRNA remains to amplify leptin from adipose tissue. These results suggest that road-kill and hunting samples could be used as a valuable source of gene-sequence information.

Notre étude a pour but de démontrer qu'il est possible d'acquérir des informations géniques à partir d'ARNm provenant d'échantillons d'animaux écrasés sur la route ou tués par des chasseurs. Des tissus adipeux ont été utilisés pour obtenir des fragments d'ADNc de l'hormone leptine et des tissus du cerveau pour obtenir l'enzyme acide glutamique décarboxylase (GAD). Des tissus d'animaux écrasés ont servi à cloner la leptine à partir d'ARN de raton laveur (Procyon lotor) et de marmotte (Marmota monax). Nous avons réussi à extraire de l'ARN et cloner GAD67 à partir d'échantillons de musaraignes cendrées (Sorex cinereus) dont l'heure de décès était inconnue. Des chasseurs nous ont fourni des tissus à partir desquels nous avons cloné la leptine et des isoformes de GAD du castor (Castor canadensis), de l'écureuil roux (Tamiasciurus hudsonicus), de l'ours noir (Ursus americanus) et de l'orignal (Alces alces americana). Des analyses de phylogénétique moléculaire ont confirmé que les séquences obtenues ne résultaient pas d'une contamination. Une analyse temporelle a démontré que même 24 h après leur mort, il restait suffisamment d'ARNm chez des rats pour amplifier la leptine à partir de leurs tissus adipeux. Ces résultats laissent croire que des échantillons prélevés sur des animaux écrasés sur les routes ou tués par des chasseurs peuvent être des sources valables d'information génique.

Document Type: Research Article

Publication date: April 1, 2003

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nrc/cjz/2003/00000081/00000004/art00013
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