Phylogenetic relationships among megachiropteran species from the two major islands of the Philippines, deduced from DNA sequences of the cytochrome b gene

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Abstract:

Complete cytochrome b gene sequences (1140 base pairs) in species of Megachiroptera were ascertained in order to deduce their phylogenetic relationships, using samples of Cynopterus brachyotis, Eonycteris spelaea, Ptenochirus jagori, Pteropus vampyrus, and Rousettus amplexicaudatus collected from the islands of Luzon and Mindanao in the Philippines. Genetic divergence between samples of R. amplexicaudatus, E. spelaea, and C. brachyotis was very small. On the other hand, a large genetic distance was detected between species of Megachiroptera. The phylogenetic tree using neighbor-joining, parsimony, and maximum-likelihood methods generated similar topologies, reflecting the evolutionary associations among megachiropteran species. We estimated that Megachiroptera separated from Microchiroptera 50.2 million years ago (MYA), and split further approximately 32.4 MYA, forming three lineages: E. spelaea, R. amplexicaudatus, and P. vampyrus and the P. jagori – C. brachyotis cluster. The third lineage, composed of P. vampyrus and the P. jagoriC. brachyotis cluster, branched out 31.9 MYA. We hypothesize that R. amplexi caudatus diverged from the three members of the subfamily Pteropodinae examined, and its phylogenetic relationship with E. spelaea remains unclear.

Les séquences complètes du gène cytochrome b (1140 paires de base) chez des mégachiroptères ont été étudiées pour déterminer leurs liens de parenté phylogénétiques, au moyen d'échantillons de Cynopterus brachyotis, Eonycteris spelaea, Ptenochirus jagori, Pteropus vampyrus et Rousettus amplexicaudatus recueillis dans les îles de Luzon et de Mindanao, Philippines. La divergence entre les échantillons de R. amplexicaudatus, E. spelaea et C. brachyotis s'est avérée très étroite. Par ailleurs, le espèces de mégachyroptères apparaissent séparées par une grande distance génétique. Les méthodes de construction d'arbres phylogénétiques, celle du voisin le plus proche, la méthode basée sur le principe de parcimonie et celle de la plus grande vraisemblance ont généré des topologies semblables reflétant l'association évolutive entre les espèces de mégachiroptères. Nous avons estimé que la séparation entre les mégachiroptères et les microchiroptères a eu lieu il y a 50,2 millions d'années (MYA) et que les mégachiroptères se sont divisés de nouveau il y a environ 32,4 MYA pour former trois lignées : E. spelaea, R. amplexicaudatus, et le groupement P. vampyrus et P. jagoriC. brachyotis. La troisième lignée, formée du groupement P. vampyrus et P. jagori – C. brachyotis s'est individualisée il y a 31,9 MYA. Nous croyons que R. amplexicaudatus s'est éloigné des trois membres de la sous-famille des Pteropodinae examinés et sa relation phylogénétique avec E. spelaea reste mal comprise.[Traduit par la Rédaction]

Document Type: Research Article

Publication date: September 1, 2001

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