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Composition of the bacterial biota in slime developed in two machines at a Canadian paper mill

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Abstract:

During the process of papermaking by pulp and paper plants, a thick and viscous deposits, termed slime, is quickly formed around the paper machines, which can affect the papermaking process. In this study, we explored the composition of the bacterial biota in slime that developed on shower pipes from 2 machines at a Canadian paper mill. Firstly, the composition was assessed for 12 months by DNA profiling with polymerase chain reaction coupled with denaturing gradient gel electrophoresis. Except for short periods (2-3 months), clustered analyses showed that the bacterial composition of the slime varied substantially over the year, with less than 50% similarity between the denaturing gradient gel electrophoresis profiles. Secondly, the screening of 16S rRNA gene libraries derived from 2 slime samples showed that the most abundant bacteria were related to 6 lineages, including Chloroflexi, candidate division OP10, Clostridiales, Bacillales, Burkholderiales, and the genus Deinococcus. Finally, the proportion of 8 bacterial lineages, such as Deinococcus sp., Meiothermus sp., and Chloroflexi, was determined by the Catalyzed Reporter Deposition - Fluorescence In Situ Hybridization in 2 slime samples. The results showed a high proportion of Chloroflexi, Tepidimonas spp., and Schlegelella spp. in the slime samples.

Lors du processus de fabrication industrielle du papier, un dépôt épais et visqueux se forme rapidement autour des machines à papier, ce qui peut affecter le processus de fabrication. Dans cette étude, nous avons exploré la composition bactérien ne du dépôt qui s’est développée sur des tuyaux des douches de 2 machines d’une usine à papier au Canada. La composition a d’abord été évaluée pendant 12 mois par la détermination du profil d’ADN par une réaction en chaîne par polymérase couplée à une électrophorèse sur gel en gradient dénaturant. À part de courtes périodes (2-3 mois), les analyses ont montré que la composition bactérienne du dépôt variait substantiellement au cours de l’année, avec moins de 50 % de similarité entre les profils en l’électrophorèse sur gel en gradient dénaturant. Deuxièmement, le criblage de banques géniques d’ARN ribosomique 16S dérivées de 2 échantillons de dépôt a ensuite montré que les bactéries les plus abondantes étaient apparentées à 6 lignées, notamment les Chloroflexi, la division candidate OP10, les Clostridiales, les Bacillales, les Burkholderiales, et le genre Deinococcus. Finalement, la proportion de 8 lignées bactériens comme Deinococcus sp., Meiothermus sp. et Chloroflexi a été déterminée par « Catalyzed Reporter Deposition - Fluorescence In Situ Hybridization » dans 2 échantillons de dépôt. Les résultats ont montré une forte proportion de Chloroflexi, Tepidimonas spp. et Schlegelella spp. dans les échantillons.

Document Type: Research Article

Publication date: 2011-02-01

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  • Published since 1954, this monthly journal contains new research in the field of microbiology including applied microbiology and biotechnology; microbial structure and function; fungi and other eucaryotic protists; infection and immunity; microbial ecology; physiology, metabolism and enzymology; and virology, genetics, and molecular biology. It also publishes review articles and notes on an occasional basis, contributed by recognized scientists worldwide.
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