Comparison of integron-linked antibiotic resistance genes in strains of Salmonella spp. isolated from swine in Chile in 2005 and 2008

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Abstract:

Salmonella spp. isolates obtained from healthy swine in 2008 were analyzed for antibiotic resistance phenotypes and genotypes. The resistance profiles of the 2008 isolates were compared with those of a Salmonella collection isolated from the same geographical area in 2005. The 2008 isolates consisted of strains that were 97% oxytetracycline resistant, 33.3% amoxicillin resistant, 31.8% amoxicillin- plus clavulanic acid resistant, 27.5% trimethoprim-sulfamethoxazole resistant, 17.3% streptomycin resistant, and 7.2% enrofloxacin-ciprofloxacin resistant. The presence of integrons and resistance genes and their topological association in resistant strains was assessed by PCR. The prevalence of class 1 integrons was the highest, at 46.2%, while class 2 integrons were present in 17.9% of the isolates. In strains that harboured class 1 integrons, we identified 3 different gene cassette arrangements; a single class 2 integron arrangement of dfrA1-sat1-aadA1 was found. Comparison of these results with data obtained from the 2005 isolates showed that Salmonella strains resistant to amoxicillin and amoxicillin plus clavulanic acid had clearly emerged over the span of 3 years, along with an increase in the prevalence of class 1 integrons and the acquisition of new gene cassette arrangements. These findings highlight the need for continual monitoring of regional isolates to establish more efficient vigilance programs that can address variations in resistance over short periods of time within the same geographical area.

Des isolats de Salmonella spp. obtenus de porcs sains au cours en 2008 ont été analysés d’un point de vue phénotypique et génotypique relativement à la résistance aux antibiotiques . Les profils de résistance des isolats de 2008 ont été comparés à ceux d’une collection de Salmonella isolée dans la même région géographique en 2005. Des souches isolées en 2008, 97 % étaient résistantes à l’oxytétracycline, 33,3 % à l’amoxicilline, 31,8 % à l’amoxicilline-acide clavulanique, 27,5 % à la triméthoprime-sulfaméthoxazole, 17,3 % à la streptomycine et 7,2 % à l’enrofloxacine-ciprofloxacine. La présence d’intégrons et de gènes de résistance, ainsi que leur association topologique dans les souches résistantes, ont été évaluées par PCR. La prévalence des intégrons de classe 1 était la plus élevée, à 46,2 %, alors que les intégrons de classe 2 étaient présents dans 17,9 % des isolats. Chez les souches comportant des intégrons de classe 1, nous avons identifié 3 arrangements de cassettes de gènes; un seul arrangement d’intégron de classe 2 de dfrA1-sat1-aadA1a été trouvé. La comparaison de ces résultats avec les données obtenues en 2005 a montré que les souches de Salmonella résistantes à l’amoxicilline et à l’amoxicilline plus acide clavulanique ont clairement émergé au cours de ces 3 ans, parallèlement à une augmentation de la prévalence des intégrons de classe 1 et à l’acquisition de nouveaux arrangement de cassettes de gènes. Ces résultats mettent en lumière le besoin de suivre continuellement les isolats régionaux afin d’établir des programmes de vigilance plus efficaces qui pourront se pencher sur les variations de la résistance sur de courtes périodes de temps à l’intérieur d’une même zone géographique.

Document Type: Research Article

Publication date: June 1, 2010

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  • Published since 1954, this monthly journal contains new research in the field of microbiology including applied microbiology and biotechnology; microbial structure and function; fungi and other eucaryotic protists; infection and immunity; microbial ecology; physiology, metabolism and enzymology; and virology, genetics, and molecular biology. It also publishes review articles and notes on an occasional basis, contributed by recognized scientists worldwide.
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