Improving the culturability of freshwater bacteria using FW70, a low-nutrient solid medium amended with sodium pyruvate

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Abstract:

Bacterial culture based on the use of plate media is an effective method for investigating bacterial populations in the environment. To improve the culturability of bacteria from freshwater lakes, we developed a new medium, FW70, which contains sodium pyruvate, casamino acids, and lake water and is solidified using gellan gum. To test the importance of these components, we prepared a series of media in which one or more of the components was absent. Water was sampled 31 times from 3 Japanese lakes and was passed through a membrane filter (pore size = 0.45 µm) to remove fast-growing microbes before the water was spread onto the plates. In most cases, significantly larger numbers of bacterial colonies were detected on FW70 than on other media. Furthermore, to test the practicality of FW70, we compared it with standard nutrient agar and R2A agar. In all cases, the culturability was significantly greater on FW70 than on standard nutrient agar or R2A agar. Some isolates recovered by means of FW70 belonged to bacteria that had not previously been classified. These results suggest that FW70 improves the culturability of freshwater bacteria and can be used for the isolation of novel bacteria as a result of the filtration step.

La culture bactérienne sur plaque est une méthode efficace d’investigation des populations bactériennes dans l’environnement. Afin d’améliorer la cultivabilité des bactéries des lacs d’eau douce, nous avons développé un nouveau milieu, le FW70, qui contient du pyruvate de sodium, des acides casaminés et de l’eau de lac, solidifié par l’ajout de gomme gellane. Pour tester l’importance de ces composantes, nous avons préparé une série de milieux dans lesquels une ou plusieurs des composantes ont été retirées. Trente et un échantillons prélevés de 3 lacs japonais ont été filtrés à travers une membrane (taille des pores = 0,45 µm) pour enlever les microbes à croissance élevée avant d’être étalés sur les plaques. Dans la plupart des cas, un nombre significativement plus élevé de colonies bactériennes a été détecté sur le milieu FW70 comparativement aux autres milieux. De plus, afin de tester l’aspect pratique du FW70, nous l’avons comparé à une gélose nutritive standard et à la gélose R2A. Dans tous les cas, la cultivabilité était plus grande sur le FW70 que sur les géloses nutritives standard et la gélose R2A. Quelques isolats récupérés sur le FW70 comportaient des bactéries encore non classifiées à ce jour. Ces résultats suggèrent que le FW70 améliore la cultivabilité des bactéries d’eau douce et qu’il peut être utilisé pour isoler de nouvelles bactéries résultant d’une filtration.

Document Type: Research Article

Publication date: April 1, 2010

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  • Published since 1954, this monthly journal contains new research in the field of microbiology including applied microbiology and biotechnology; microbial structure and function; fungi and other eucaryotic protists; infection and immunity; microbial ecology; physiology, metabolism and enzymology; and virology, genetics, and molecular biology. It also publishes review articles and notes on an occasional basis, contributed by recognized scientists worldwide.
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