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Molecular and morphological markers for rapid distinction between 2 Colletotrichum species

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Endophytic microorganisms reside asymptomatically within plants and are a source of new bioactive products for use in medicine, agriculture, and industry. Colletotrichum (teleomorph Glomerella) is a fungus widely cited in the literature as a producer of antimicrobial substances. Identification at the species level, however, has been a problem in this type of study. Several authors have reported the presence of endophytic fungi from the medicinal plant Maytenus ilicifolia (“espinheira-santa”) in Brazil that has antimicrobial activity against various pathogens. Therefore, Colletotrichum strains were isolated from M. ilicifolia and identified based on morphology, RAPD markers, sequence data of the internal transcribed spacer regions (ITS-1 and ITS-2), the 5.8S gene, and species-specific PCR. The analyses suggested the presence of 2 species, Colletotrichum gloeosporioides and Colletotrichum boninense. Two morphological markers were characterized to allow C. gloeosporioides and C. boninense to be distinguished quickly and accurately. The molecular diagnosis of C. boninense was confirmed by using Col1 and ITS4 primers. This species of Colletotrichum is reported for the first time in M. ilicifolia.

Les microorganismes endophytes résident de façon asymptomatique à l’intérieur des végétaux et constituent une source de nouveaux produits bioactifs utilisables en médecine, en agriculture et dans l’industrie. Colletotrichum (téléomorphe Glomerella) est un champignon largement cité dans la littérature comme producteur de substances antimicrobiennes. L’identification à l’échelle de l’espèce a cependant été problématique dans ce type d’études. Plusieurs auteurs ont rapporté la présence de champignons endophytes dans la plante médicinale du Brésil Maytenus ilicifolia (« espinheira-santa) qui possède une activité antimicrobienne envers divers pathogènes. Ainsi, les souches de Colletotrichum ont été isolées de M. ilicifolia et ont été identifiées à partir de leur morphologie, des marqueurs RAPD, des données de séquences de la région de l’espaceur transcrit interne (ITS-1, ITS-2), du gène 5.8S et des PCR spécifiques aux espèces. Ces analyses suggèrent la présence de deux espèces, C. gloeosporioides et C. boninense. Deux marqueurs morphologiques ont été caractérisés pour permettre de distinguer rapidement et précisément C. gloeosporioides et C. boninense. Le diagnostic moléculaire de C.boninense a été confirmé à l’aide des amorces Col1/ITS4. La présence de cette espèce de Colletotrichum est rapportée pour la première fois chez M. ilicifolia.

Document Type: Research Article

Publication date: September 1, 2009

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  • Published since 1954, this monthly journal contains new research in the field of microbiology including applied microbiology and biotechnology; microbial structure and function; fungi and other eucaryotic protists; infection and immunity; microbial ecology; physiology, metabolism and enzymology; and virology, genetics, and molecular biology. It also publishes review articles and notes on an occasional basis, contributed by recognized scientists worldwide.
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