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Isolation, characterization, and effect of fluorescent pseudomonads on micropropagated sugarcane

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In this study, we report on the isolation, identification, and characterization of seven fluorescent pseudomonads isolated from the roots, shoots, and rhizosphere soil of sugarcane and their impacts on the growth of sugarcane plantlets. 16S rRNA gene sequence of five isolates showed close homology with Pseudomonas putida, one with Pseudomonas graminis, and one with Pseudomonas fluorescens. Physiological and biochemical characterizations were determined using API50CH and QTS24 identification kits. The isolates were also subjected to tests for various known growth promoting properties including production of indole acetic acid, the ability to fix nitrogen via the presence of the nifH gene, and ability to solubilize phosphate. Biological control potential was determined from agar diffusion assays of HCN production and production of antifungal compounds against local isolates of Colletotrichum falcatum (that induces red-rot disease of sugarcane). Direct plant growth promoting effects were tested on sugarcane plantlets in tissue culture under gnotobiotic conditions. All seven isolates provided significant increases in fresh and dry masses but only five strains increased shoot height.

Dans cette étude, nous rapportons l’isolement, l’identification et la caractérisation de sept pseudomonades fluorescentes isolées des racines, des pousses et du sol de la rhizosphère de la canne à sucre, ainsi que leurs impacts sur la croissance des plantules de canne à sucre. La séquence du gène de l’ARNr 16S de cinq isolats a montré une forte homologie avec Pseudomonas putida, un avec Pseudomonas graminis et un avec Pseudomonas fluorescens. Les caractérisations physiologiques et biochimiques ont été déterminées à l’aide des trousses d’identification API50 et QTS24. Les isolats ont été aussi soumis à des tests visant à détecter des propriétés connues de promotion de la croissance, notamment la production d’acide indole acétique, la capacité de fixation d’azote via la présence du gène nifH et la capacité de solubilisation du phosphate. Le potentiel de contrôle biologique a été déterminé par des essais de diffusion sur gélose de production de HCN et de production de composés antifongiques dirigés contre des isolats locaux de Colletotrichum falcatum (qui induit la maladie de la pourriture rouge de la canne à sucre). Les effets directs de promotion de la croissance ont été testés sur les plantules de canne à sucre en culture de tissus sous des conditions gnotobiotiques. Les sept isolats ont généré des augmentations significatives du poids à l’état frais et du poids sec, mais seules cinq souches ont permis d’augmenter la longueur des pousses.

Document Type: Research Article

Publication date: August 1, 2009

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  • Published since 1954, this monthly journal contains new research in the field of microbiology including applied microbiology and biotechnology; microbial structure and function; fungi and other eucaryotic protists; infection and immunity; microbial ecology; physiology, metabolism and enzymology; and virology, genetics, and molecular biology. It also publishes review articles and notes on an occasional basis, contributed by recognized scientists worldwide.
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