Properties of an alginate-degrading Flavobacterium sp. strain LXA isolated from rotting algae from coastal China

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Abstract:

A novel bacterium exhibiting alginolytic activity was isolated from rotten algae. The alginate-degrading activity was detected in the culture supernatant by measuring the decrease in alginate viscosity or the increase in reducing sugars. Basic characterization showed that it was gram negative, rod shaped, yellow pigmented, and positive for oxidase and catalase, with a DNA G+C content of 35.6 mol%. Phylogenetic analysis based on 16S rRNA gene sequences indicated that this strain is related to members of the genus Flavobacterium. Sequence similarity values with their nearest phylogenetic neighbours ranged from 95.9% to 96.7%. Genotypic results, together with phenotypic characteristics, differentiated this species from related Flavobacterium organisms with validly published names, which suggests that the organism should be a new species of the genus Flavobacterium tentatively named as Flavobacterium sp. strain LXA.

Une nouvelle bactérie présentant une activité alginolytique a été isolée d’algues en décomposition. L’activité de dégradation de l’alginate a été détectée dans leur surnageant de culture en mesurant la diminution de la viscosité de l’alginate ou l’augmentation des sucres réducteurs. La caractérisation de base a montré qu’il s’agissait d’une bactérie gram-négative, de forme allongée, à pigments jaunes, et positive en oxydase et en catalase, dont le contenu en G+C de l’ADN était de 35,6 mol %. L’analyse phylogénique basée sur le séquençage du gène de l’ARNr 16S a indiqué que cette souche était reliée aux membres du genre Flavobacterium. Les valeurs de similarité de séquence avec leurs plus proches parents phylogéniques se situaient entre 95,9 % et 96,7 %. Les résultats génotypiques, conjugués aux caractéristiques phénotypiques, ont permis de distinguer cette espèce des Flavobacterium reliées dont les noms ont été validés, ce qui suggère que cet organisme puisse constituer une nouvelle espèce du genre Flavobacterium, nommée de façon provisoire Flavobacterium sp. souche LXA.

Document Type: Research Article

Publication date: April 1, 2008

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