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Diversity of predominant endophytic bacteria in European deciduous and coniferous trees

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The diversity of endophytic bacteria residing in root, stem, and leaf tissues was examined in coniferous and deciduous tree species, Scots pine (Pinus sylvestris L.), silver birch (Betula pendula Roth), and rowan (Sorbus aucuparia L.). Using cultivation-dependent and -independent analyses, the bacterial communities were observed to be significantly different in the belowground (roots and rhizosphere) and aboveground (leaves and stems) samples of the respective host trees. No significant differences, with respect to the different tree species, were observed in the associated communities. Predominant cultivable endophytes isolated included bacteria closely related to Bacillus subtilis, Bacillus licheniformis, Paenibacillus spp., and Acinetobacter calcoaceticus. Comparisons of the most abundant cultivable bacteria in the rhizosphere and root samples suggested that root endophytic bacteria may be in residence through processes of selection or active colonization rather than by passive diffusion from the rhizosphere.

La diversité des bactéries endophytes qui résident dans les tissus des racines, du tronc et des feuilles a été examinée chez des espèces de conifères et d’arbres à feuilles caduques : le pin sylvestre (Pinus sylvestris L.), le bouleau blanc (Betula pendula Roth) et le sorbier des oiseleurs (Sorbus aucuparia L.). À l’aide d’analyses dépendantes ou indépendantes de la culture, nous avons observé que les communautés bactériennes étaient significativement différentes selon que les tissus de leurs hôtes respectifs se situaient sous la terre (racines et rhizophère) ou hors terre (feuilles, tronc). Aucune différence significative en fonction des différentes espèces d’arbres n’a été observée dans les communautés associées. Les endophytes cultivables prédominants isolés comprenaient des bactéries fortement reliées à Bacillus subtilis, Bacillus licheniformis, Paenibacillus spp. et Acinetobacter calcoaceticus. Les comparaisons réalisées avec les bactéries cultivables les plus abondantes dans la rhizosphère et dans les échantillons de racines ont suggéré que les bactéries endophytes des racines puissent établir leur résidence par un processus de sélection ou de colonisation active plutôt que par diffusion passive à partir de la rhizosphère.

Document Type: Research Article

Publication date: March 3, 2008

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  • Published since 1954, this monthly journal contains new research in the field of microbiology including applied microbiology and biotechnology; microbial structure and function; fungi and other eucaryotic protists; infection and immunity; microbial ecology; physiology, metabolism and enzymology; and virology, genetics, and molecular biology. It also publishes review articles and notes on an occasional basis, contributed by recognized scientists worldwide.
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