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Seasonal influences on fungal community structure in unimproved and improved upland grassland soils

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Abstract:

Seasonal and management influences on the fungal community structure of two upland grassland soils were investigated. An upland site containing both unimproved floristically diverse (U4a) and improved mesotrophic (MG7b) grassland types was selected. Samples from both grassland types were taken at five times in one year. Soil fungal community structure was assessed using fungal automated ribosomal intergenic spacer analysis (ARISA), a DNA-profiling approach. A grassland management regime was found to strongly affect fungal community structure, with fungal ARISA profiles from unimproved and improved grassland soils differing significantly. The number of fungal ribotypes found was higher in unimproved than improved grassland soils, providing evidence that improvement may reduce the suitability of upland soil as a habitat for specific groups of fungi. Seasonal influences on fungal community structure were also noted, with samples taken in autumn (October) more correlated with change in ribotype profiles than samples from other seasons. However, seasonal variation did not obscure the measurement of differences in the fungal community structure that were due to agricultural improvement, with canonical correspondence analysis indicating grassland type had a stronger influence on fungal profiles than did season.Key words: upland grasslands, fungal automated ribosomal intergenic spacer analysis, seasonality, improvement, canonical correspondence analysis.

L'impact des saisons et de la gestion des sols sur la structure des communautés de champignons de deux sols de prairie en haute élévation a été étudié. Un site de hautes terres contenant des types de prairies non améliorés et diversifiés au point de vue de la flore (U4a) de même que des types améliorés (MG7b) fut sélectionné et des échantillons des deux types de prairies furent prélevés à cinq moments dans une année. La structure de communautés fongiques du sol fut évaluée à l'aide d'une analyse automatisée de l'espaceur intergénique ribosomal (ARISA), une approche de profilage d'ADN. Nous avons constaté que les régimes de gestion des prairies influencent grandement la structure communautaire fongique, les profils ARISA fongiques provenant de sols de prairies non améliorés et améliorés différant de manière significative. Le nombre de ribotypes fongiques retrouvé était supérieur dans les sols de prairies non améliorés versus améliorés, ce qui tend à démontrer que l'amélioration pourrait diminuer la capacité des sols en terre hautes à servir d'habitat pour des groupes spécifiques de champignons. L'influence des saisons sur la structure des communautés fongiques fut également notée, les échantillons prélevés en automne (octobre) ayant davantage corrélé avec des changements dans les profils de ribotypes que les échantillons d'autres saisons. Toutefois, les variations saisonnières n'ont pas obscurci la mesure des différences dans la structure de communautés fongiques qui étaient attribuables à l'amélioration agricole puisqu'une analyse de correspondance canonique a indiqué que le type de prairies avait une influence supérieure sur les profils fongiques que la saison.Mots clés : prairie, analyse automatisée de l'espaceur intergénique ribosomal fongique, saisonnalité, amélioration, analyse de correspondance canonique.[Traduit par la Rédaction]

Document Type: Research Article

Publication date: July 1, 2006

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  • Published since 1954, this monthly journal contains new research in the field of microbiology including applied microbiology and biotechnology; microbial structure and function; fungi and other eucaryotic protists; infection and immunity; microbial ecology; physiology, metabolism and enzymology; and virology, genetics, and molecular biology. It also publishes review articles and notes on an occasional basis, contributed by recognized scientists worldwide.
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nrc/cjm/2006/00000052/00000007/art00012
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