Endophytic Phomopsis species: host range and implications for diversity estimates

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Abstract:

Foliar endophyte assemblages of teak trees growing in dry deciduous and moist deciduous forests of Nilgiri Biosphere Reserve were compared. A species of Phomopsis dominated the endophyte assemblages of teak, irrespective of the location of the host trees. Internal transcribed spacer sequence analysis of 11 different Phomopsis isolates (ten from teak and one from Cassia fistula) showed that they fall into two groups, which are separated by a relatively long branch that is strongly supported. The results showed that this fungus is not host restricted and that it continues to survive as a saprotroph in teak leaf, possibly by exploiting senescent leaves as well as the litter. Although the endophyte assemblage of a teak tree growing about 500 km from the forests was also dominated by a Phomopsis sp., it separated into a different group based on internal transcribed spacer sequence analysis. Our results with an endophytic Phomopsis sp. reinforce the earlier conclusions reached by others for pathogenic Phomopsis sp., i.e., that this fungus is not host specific, and the species concept of Phomopsis needs to be redefined.Key words: fungal endophytes, Tectona grandis, fungal diversity, Phomopsis, host restriction.

Nous avons comparé des assemblages d'endophytes foliaires de tecks de forêts caduques sèches et humides de la Réserve Biosphère du Nilgiri. Une espèce de Phomopsis a dominé les assemblages d'endophytes de tecks quelle que soit la localisation des arbres hôtes. Une analyse des séquences d'espaceur interne transcrit de onze différents isolats de Phomopsis (dix d'arbres teck et un de Cassia fistula) a montré que ceux-ci se divisent en deux groupes qui sont séparés par une branche relativement longue qui est fortement soutenue. Les résultats démontrent que ce champignon n'est pas limité à un hôte et qu'il continue à survivre en tant que saprotrophe dans les feuilles de teck, vraisemblablement en exploitant les feuilles sénescentes de même que la litière. Bien que l'assemblage d'endophytes d'un teck poussant à 500 km des forêt fut également dominé par un Phomopsis sp., celui-ci s'est séparé en un groupe différent selon l'analyse de sa séquence d'espaceur interne transcrit. Nos résultats à propos du Phomopsis endophyte renforce les conclusions précédentes tirées par d'autres sur le Phomopsis pathogène selon lesquelles ce champignon ne serait pas spécifique à l'hôte et que le concept d'espèces pour Phomopsis a besoin d'être redéfini.Mots clés : champignons endophyte, Tectona grandis, diversité fongique, Phomopsis, restriction à l'hôte.[Traduit par la Rédaction]

Document Type: Research Article

Publication date: July 1, 2006

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  • Published since 1954, this monthly journal contains new research in the field of microbiology including applied microbiology and biotechnology; microbial structure and function; fungi and other eucaryotic protists; infection and immunity; microbial ecology; physiology, metabolism and enzymology; and virology, genetics, and molecular biology. It also publishes review articles and notes on an occasional basis, contributed by recognized scientists worldwide.
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