Development of selective media for the isolation and enumeration of Alternaria species from soil and plant debris

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A new semi-selective medium, acidified weak potato-dextrose agar (AWPDA) with Mertect (active ingredient: thiabendazole), was developed for the isolation and enumeration of Alternaria species from samples of soil and plant debris. The medium was selected based on growth inhibition tests against Alternaria and several other commonly encountered saprobic fungi utilizing three antifungal agents, Botran (active ingredient: dichloran), Bayleton (active ingredient: triadimefon), and Mertect, and two basal media, acidified potato-dextrose agar (APDA) and AWPDA. Botran inhibited growth of Rhizopus stolonifer moderately, but had little effect on Cladosporium cladosporoides, Fusarium oxysporum, Penicillium chrysogenum, or Trichoderma harzianum. Bayleton inhibited growth of R. stolonifer and C. cladosporoides severely, and inhibited growth of F. oxysporum, P. chrysogenum, and T. harzianum moderately. Mertect inhibited growth of C. cladosporoides, F. oxysporum, P. chrysogenum, and T. harzianum completely, but had little or moderate effect on R. stolonifer. All three antifungal agents inhibited growth of Alternaria species slightly or moderately. The combination of Bayleton and Mertect inhibited growth of all fungi severely. A comparison of recovery rates of Alternaria from soil and plant debris samples on AWPDA with Mertect and weak potato-dextrose agar (WPDA) revealed that Alternaria spp. accounted for 63.6%–81.0% of recovered fungal isolates on AWPDA with Mertect as compared to 0.6%–2.7% of recovered isolates on WPDA. The AWPDA medium with Mertect exhibited superior selective growth of Alternaria species from samples of soil and plant debris, and will be useful in studies where the recovery and enumeration of Alternaria species is necessary.Key words: Alternaria, AWPDA, selective media, sporulation, Mertect.

Un nouveau milieu semi-sélectif, l'agar faible dextrose pomme de terre acidifié (AFDPA) contenant du Mertect (ingrédient actif : thiabendazole), a été conçu pour l'isolation et l'énumération d'espèce d'Alternaria à partir d'échantillons de sol et de débris végétaux. Le milieu a été sélectionné en se fondant sur des analyses d'inhibition de la croissance d'Alternaria et de plusieurs autres champignons saprobes communs à l'aide d'une assortiment de trois agents antifongiques, le Botran (ingrédient actif : dichloran), le Bayleton (ingrédient actif : triadimefon) et le Mertect, et de deux milieux de base, l'agar dextrose pomme de terre acidifié (ADPA) et l'AFDPA. Le Botran a modérément inhibé la croissance du Rhizopus stolonifer, mais n'a eu qu'un effet négligeable sur le Cladosporium cladosporoides, le Fusarium oxysporum, le Penicillium chrysogenum, ou le Trichoderma harzianum. Le Bayleton a fortement inhibé la croissance du R. stolonifer et du C. cladosporoides, et a modérément inhibé la croissance du F. oxysporum, du P. chrysogenum et du T. harzianum. Le Mertect a complètement inhibé la croissance du C. cladosporoides, du F. oxysporum, du P. chrysogenum et du T. harzianum, mais n'eût qu'un impact modéré ou négligeable sur le R. stolonifer. Le Bayleton et le Mertect utilisés en combinaison ont fortement inhibé le développement de tous les champignons. Une comparaison des vitesses de récupération d'Alternaria présents dans des échantillons provenant du sol ou de débris végétaux incubés sur du AFDPA avec Mertect et de l'agar faible dextrose pomme de terre (AFDP) a révélé que 63,6 – 81,0 % des champignons isolés sur du AFDPA avec Mertect étaient des Alternaria spp., comparativement à 0,6 – 2,7 % des isolats recueillis sur l'AFDP. Le milieu AFDPA avec Mertect a permis d'obtenir le meilleur développement préférentiel d'espèces d'Alternaria d'échantillons de sol et de débris végétaux, et s'avèrera utile lorsque l'isolation et l'énumération d'espèces d'Alternaria seront requises.Mots clés : Alternaria, AFDPA, milieu sélectif, sporulation, Mertect.[Traduit par la Rédaction]

Document Type: Research Article

Publication date: July 1, 2004

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  • Published since 1954, this monthly journal contains new research in the field of microbiology including applied microbiology and biotechnology; microbial structure and function; fungi and other eucaryotic protists; infection and immunity; microbial ecology; physiology, metabolism and enzymology; and virology, genetics, and molecular biology. It also publishes review articles and notes on an occasional basis, contributed by recognized scientists worldwide.
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