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Molecular and physiological comparison of Azospirillum spp. isolated from Rhizoctonia solani mycelia, wheat rhizosphere, and human skin wounds

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Four phenotypically similar bacterial strains isolated from fungal, plant, and human sources were identified as Azospirillum species. Strains RC1 and LOD4 were isolated from the mycelium of the apple root pathogen Rhizoctonia solani AG 5 and from the rhizosphere of wheat grown in apple orchard soil, respectively. Strains C610 and F4626 isolated from human wounds were previously misclassified as Roseomonas genomospecies 3 and 6. All four strains demonstrated close similarities in 16S rRNA gene sequences, having 97% identity to Azospirillum brasilense type strain ATCC 29145 and <90% identity to Roseomonas gilardii, the Roseomonas type strain. Extensive phenotypic similarities among the four strains included the ability of free-living cells to fix N2. Cells of strains RC1, LOD4, and C610 but not of strain F4626 could be induced to flocculate by incubation with 10 mmol·L–1 glycerol or fructose in medium containing 0.5 mmol·L–1 NO3. Our results indicate a wide range of potential sources for Azospirillum spp. with the isolation of Azospirillum spp. from human wounds warranting further investigation.Key words: Azospirillum brasilense, Roseomonas fauriae, flocculation, Rhizoctonia solani.

Quatre souches de bactéries phénotypiquement semblables ont été isolées à partir de sources fongiques, végétales et humaines, et identifiées comme étant des espèces de Azospirillum. Les souches RC1 et LOD4 ont été isolées respectivement du mycélium de Rhizoctonia solani AG 5, un pathogène des racines du pommier, et de la rhizosphère de blé cultivé dans de la terre de verger. Les souches C610 et F4626 ont été isolées de blessures humaines et avaient auparavant été classifiées incorrectement en tant qu'espèces génomiques 3 et 6 de Roseomonas. Les séquences de l'ARNr 16S des quatre souches étaient fortement semblables à celle de la souches type de Azospirillum brasilense ATCC 29145, avec 97 % d'identité, et avaient <90 % d'identité avec Roseomonas gilardii, la souches type de Roseomonas. La capacité des cellules libres à fixer le N2 faisait partie des multiples similarités phénotypiques entre les quatre souches. Un incubation des cellules des souches RC1, LOD4 et C610, mais non de F4626, avec 10 mmol·L–1 de glycérol ou du fructose dans un milieu contenant 0,5 mmol·L–1 NO3 a provoqué la floculation de celles-ci. Nos résultats révèlent l'existence d'une grande variété de sources potentielles d'Azospirillum spp. En particulier, l'isolation d'Azospirillum spp. à partir de blessure humaines sollicite un examen plus approfondi.Mots clés : Azospirillum brasilense, Roseomonas fauriae, floculation, Rhizoctonia solani.[Traduit par la Rédaction]

Document Type: Research Article

Publication date: 2004-04-01

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  • Published since 1954, this monthly journal contains new research in the field of microbiology including applied microbiology and biotechnology; microbial structure and function; fungi and other eucaryotic protists; infection and immunity; microbial ecology; physiology, metabolism and enzymology; and virology, genetics, and molecular biology. It also publishes review articles and notes on an occasional basis, contributed by recognized scientists worldwide.
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