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Diversity of antifungal actinomycetes in various vegetative soils of Korea

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Abstract:

Diversity of actinomycetes and their antifungal activities against some plant pathogenic fungi were examined in various vegetative soils from 14 different sites in the western part of Korea. Actinomycete counts ranged from 1.17 × 106 to 4.20 × 106 cfu·g-1 dried soil. A total of 1510 actinomycetes were isolated from the soil samples. Streptomyces was predominant in soils with a pH range of 5.1-6.5, 9.1-13.0% moisture, and 9.1-11.0% organic matter. Most Micromonospora, Dactylosporangium, and Streptosporangium were distributed in soils with pH 4.0-5.0, 2.0-9.0% moisture, and 4.0-7.0% organic matter. Actinomadura and nocardioform actinomycetes were abundant in soils with pH 4.0-5.0 and 13.1-20.0% moisture and with 9.1-11.0 and 4.0-7.0% organic matter, respectively. Populations of Streptomyces were predominant in all the soils, but were highest in grassland and lowest in mountain-forest soils. Micromonospora was most abundant in pepper-field soil and nocardioform actinomycetes were highest in rice paddy field soil. Dactylosporangium was predominant in lake-mud sediments and pepper-field soil, Streptosporangium in lake-mud sediments, and Actinomadura in mountain-forest soil. Antifungal actinomycetes were abundant in orchard soil and lake mud. More than 50% of antifungal isolates from most soils were classified as genus Streptomyces. Actinomycete isolates that showed strong antifungal activity against Alternaria mali, Colletotrichum gloeosporioides, Fusarium oxysporum f.sp. cucumerinum, and Rhizoctonia solani were predominant in pepper-field soils, whereas those against Magnaporthe grisea and Phytophthora capsici were abundant in radish-field soils.Key words: actinomycetes, antifungal activity, plant pathogenic fungi, vegetative soils.

Nous avons examiné la diversité des actinomycètes qui provenaient de différents sols sous couvert végétal prélevés à 14 sites localisés dans l'ouest de la Corée et avons évalué leur activité antifongique envers certains champignons phytopathogènes. Les dénombrements d'actinomycètes ont varié de 1,17 × 106 à 4,20 × 106 ufc·g-1 de sol sec. Au total, 1510 actinomycètes ont été isolés de ces échantillons de sol. Les Streptomyces prédominaient dans les sols dont le pH était de 5,1 à 6,5, l'humidité de 9,1 à 13% et qui contenaient 9,1-11% de matière organique. La majorité des Micromonospora, Dactylosporangium et des Streptosporangium se retrouvaient dans les sols où le pH était 4,0-5,0, avec une humidité de 2,0 á 9,0% et qui contenaient 4,0-7,0% de matière organique. Les Actinomadura et les actinomycètes nocardioformes étaient abondants dans les sols à pH 4,0-5,0, dont l'humidité était de 13,1 à 20,0% et qui contenaient respectivement 9,1-11,0 et 4,0-7,0% de matière organique. Les populations de Streptomyces prédominaient dans tous les sols, mais les valeurs les plus élevées s'observaient dans les sols récoltés dans les prairies et les plus faibles dans les sols forestiers montagneux. Micromonospora était le plus abondant dans le sol de plantations de poivriers et la concentration la plus élevée des actinomycètes nocardioformes a été observée dans le sol des rizières. Les Dactylosporangium étaient retrouvés en prédominance dans les sédiments boueux des lacs et dans le sol des plantations de poivriers, les Streptosporangium dans les sédiments boueux des lacs et les Actinomadura dans les sols forestiers en montagne. Les actinomycètes antifongiques étaient abondants dans les sols des vergers et des sédiments boueux des lacs. Plus de 50% des isolats antifongiques présents dans la plupart des sols ont été classés dans le genre Streptomyces. Les isolats d'actinomycètes qui démontraient une forte activité antifongique contre Alternaria mali, Colletotrichum gloeosporioides, Fusarium oxysporum f.sp. cucumerinum et Rhizoctonia solani se retrouvaient en prédominance dans les sols de plantations de poivriers tandis que les isolats actifs envers Magnaporthe grisea et Phytophthora capsici étaient abondants dans les sols de plantations de radis.Mots clés : actinomycètes, activité antifongique, champignons phytopathogè

Keywords: actinomycetes; actinomycètes; activité; antifongique; antifungal activity; champignons phytopathogènes; plant pathogenic fungi; sols sous couvert végétal; vegetative soils

Document Type: Research Article

Publication date: May 1, 2002

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