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In situ molecular detection of some white-rot and brown-rot basidiomycetes infecting temperate and tropical woods

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Abstract:

Wood-decay white-rot and brown-rot fungi have a major economic impact on commercial and manufactured tropical and temperate woods. The aim of this study was to design a molecular method, coupled with polymerase chain reaction (PCR) and DNA sequencing, to enable early identification of various forms of fungal decay in various types of wood. The resulting tool could be used to certify the healthiness of commercial woods and also to make more efficient use of chemicals and thus reduce their negative environmental impact. Sapwood plates of Distemonanthus benthamianus,Fagus sylvatica, Lophira alata, Pinus sylvestris, and Pycnanthus angolensis were incubated in vitro in the presence of Fibroporia vaillantii, Coniophora puteana, Gloeophyllum trabeum, Pycnoporus sanguineus, and Trametes versicolor according to the EN 113 standard method. Average mass losses ranging from 2.6% to 25.0% indicated that all wood samples had been actually infected and enabled us to test the reliability of our method. PCR products were obtained in 24 of 25 combinations, and DNA sequences were obtained in 21 of the 24 fungal PCR products. DNA sequences obtained from infected wood were compared with sequences from pure strains, thus confirming the identity of the infecting strains with 100% similarity for an average of 412 bp.

Les champignons de pourriture blanche et de pourriture brune qui décomposent le bois ont un impact économique majeur sur les essences commerciales des zones tempérée et tropicale et sur les produits manufacturés. L'objectif de cette étude consistait à mettre au point une méthode moléculaire faisant appel à la réaction en chaîne de le polymerase et au séquençage d'ADN pour permettre l'identification précoce de diverses formes de champignons de pourriture dans différents types de bois. L'outil ainsi mis au point pourrait être utilisé pour garantir que des bois commerciaux sont sains et pour faire un usage plus efficace des produits chimiques et par conséquent réduire leur impact négatif sur l'environnement. Des plaquettes d'aubier de Distemonanthus benthamianus, Fagus sylvatica, Lophira alata, Pinus sylvestris et Pycnanthus angolensis ont été incubés in vitro en présence de Fibroporia vaillantii, Coniophora puteana, Gloeophyllum trabeum, Pycnoporus sanguineus et Trametes versicolor selon la méthode standard EN 113. Des pertes de poids variants de 2,6 à 25 % indiquaient que tous les échantillons de bois avaient réellement été infectés, ce qui permettait de tester la fiabilité de notre méthode. L'amplification a fonctionné pour 24 des 25 combinaisons et des séquences d'ADN ont été obtenues pour 21 des 24 amplifications d'ADN fongique. Les séquences d'ADN provenant du bois infecté ont été comparées aux séquences des cultures pures, confirmant ainsi l'identité de la culture responsable de l'infection avec 100% de similarité pour une moyenne de 412 bp.[Traduit par la Rédaction]

Document Type: Research Article

Publication date: May 1, 2005

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nrc/cjfr/2005/00000035/00000005/art00023
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