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Best linear unbiased prediction of clonal breeding values and genetic values from full-sib mating designs

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Abstract:

Full-sib progeny tests with clonal replicates may provide better breeding value estimates and the greatest genetic gain in a tree improvement program. Clonal breeding values (CBV) that combine the family and within-family breeding values due to additive genetic effects can maximize the genetic gain for advanced generation breeding. Clonal genetic values (CGV) that further incorporate full-sib family specific combining ability due to nonadditive genetic effect can maximize gain for a deployment program with clonal propagation techniques. The best linear unbiased prediction (BLUP) is the best statistical method for estimating both CBV and CGV because of its desirable statistical properties compared with the heritability-based gain calculation. A BLUP method for determining both the CBV and CGV for full-sib clonal progeny tests was proposed in this paper. The formulas for CBV and CGV were derived using general BLUP methodology, and formulas were derived for the calculations of their standard errors. An analytical method by using a standard statistical package (SAS PROC MIXED) was presented for CBV and CGV calculations from any full-sib mating designs.

Les tests de descendances biparentales comprenant des réplicats clonaux peuvent fournir de meilleures estimations des valeurs en croisement et les gains génétiques les plus élevés en amélioration des arbres. Les valeurs en croisement clonales (VCC) qui combinent à la fois les valeurs en croisement familiales et intra-familiales découlant des effets génétiques additifs peuvent maximiser le gain génétique lors des cycles de sélection avancés. Les valeurs génétiques clonales (VGC) qui, en plus, intègrent l'aptitude spécifique à la combinaison découlant des effets génétiques non additifs chez les familles biparentales, peuvent maximiser le gain pour un programme de déploiement impliquant le recours aux techniques de multiplication clonale. La meilleure prédiction linéaire non biaisée représente la meilleure approche statistique pour estimer à la fois les VCC et les VGC en raison des ses propriétés statistiques désirables comparativement aux calculs de gain impliquant l'héritabilité. Les auteurs proposent la meilleure prédiction linéaire non biaisée comme méthode pour déterminer à la fois les VCC et les VGC à partir de tests de descendances biparentales comprenant des réplicats clonaux. Les formules pour calculer les VCC et les VGC ont été déterminées à l'aide de la méthodologie générale de la meilleure prédiction linéaire non biaisée ainsi que les formules requises pour le calcul de leur erreur type. Une approche analytique ayant recours à un progiciel statistique commun (SAS PROC MIXED) est décrite pour effectuer le calcul des VCC et des VGC à partir de n'importe quel dispositif de croisements biparentaux.[Traduit par la Rédaction]

Document Type: Research Article

Publication date: October 1, 2003

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nrc/cjfr/2003/00000033/00000010/art00022
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