Population genetic structure in the redefined vermilion rockfish (Sebastes miniatus) indicates limited larval dispersal and reveals natural management units

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Abstract:

Recent studies have revealed that the vermilion rockfish Sebastes miniatus is a cryptic species pair. The splitting of this species impacts stock size estimates and draws attention to the unintended consequences of current management policies. Differences in exploitation level between the species necessitated an evaluation of population structure and connectivity among regional management segments of the fishery. Analysis of gene flow and calculations of larval dispersal values were accomplished using 782bp of DNA sequence data from the mitochondrial cytochromeb gene of 684 vermilion rockfish sampled from 16 sites between Kyuquot Sound, Canada, and San Quintin, Mexico. Significant genetic heterogeneity was found among sample sites (φST = 0.0742, p< 0.001 and FST = 0.0899, p< 0.001). Isolation by distance analysis produced a significant correlation, suggesting low average larval dispersal distance. Analysis of molecular variance showed significant partitioning of genetic variance across the biogeographic boundary at Point Conception (φCT = 0.0923, p< 0.001 and FCT = 0.0135, p< 0.001) with additional genetic barriers found at Cape Mendocino, Punta Colnett, Santa Monica Bay, and along the coast of Washington. These genetic barriers conform to oceanographic compartments previously proposed for the California Current Ecological Province and suggest natural management units for this species.

Des études récentes ont montré que le sébaste vermillon Sebastes miniatus représente en fait une paire d’espèces cryptiques. La séparation de cette espèce a des répercussions sur les estimations de taille des stocks et souligne les conséquences imprévues des politiques actuelles de gestion. Des différences de niveaux d’exploitation entre les deux espèces nécessitent une évaluation de la structure de population et de la connectivité entre les secteurs régionaux de gestion de cette pêche. L’analyse du flux génique et le calcul des taux de dispersion larvaire se sont faits à partir des données de séquençage de 782pb d’ADN du gène mitochondrial du cytochromeb chez 684 sébastes vermillons provenant de 16 sites entre le détroit de Kyuquot, Canada, et San Quintin, Mexique. Il existe une hétérogénéité génétique significative entre les sites d’échantillonnage (φST = 0,0742, p < 0,001 et FST = 0,0899, p < 0,001). Une analyse d’isolement par la distance produit une corrélation significative, ce qui laisse croire à une faible distance moyenne de dispersion larvaire. L’analyse de la variance moléculaire montre un partionnement significatif de la variance génétique à travers la frontière biogéographique de Point Conception (φCT = 0,0923, p < 0,001 et FCT = 0,0135, p < 0,001) avec des barrières génétiques additionnelles au cap Mendocino, à Punta Colnett, dans la baie de Santa Monica et le long de la côte de l’état de Washington. Ces barrières génétiques correspondent aux compartiments océaniques proposés antérieurement pour la province écologique du courant de Californie et indiquent des unités naturelles de gestion pour cette espèce.

Document Type: Research Article

Publication date: September 1, 2009

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