Phylogenetic position of Arabis arenicola and generic limits of Aphragmus and Eutrema (Brassicaceae) based on sequences of nuclear ribosomal DNA

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Abstract:

Sequence data from the nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region of 45 taxa were used to determine the phylogenetic relationship of Arabis arenicola to Arabis, Arabidopsis, Braya, and Eutrema, and that of Eutrema to the purportedly related genera Aphragmus, Lignariella, Neomartinella, Platycraspedum, Taphrospermum, and Thellungiella. Arabis arenicola was originally described as Eutrema in 1830, transferred to Arabis in 1898, and has remained in Arabis to the present, even though it is morphologically more similar to Arabidopsis, Braya, and Eutrema. Sequence data were obtained from representative taxa of Arabis, Arabidopsis, and related Boechera and Catolobus, Braya and Neotorularia, and Eutrema, Aphragmus, Lignariella, Neomartinella, Platycraspedum, Taphrospermum, and Thellungiella. The five Arabis arenicola accessions examined had ITS sequences that were identical to each other and to four Arabidopsis lyrata accessions. In both maximum parsimony and maximum likelihood analyses, Arabis arenicola fell within the Arabidopsis clade and was closely aligned with Arabidopsis lyrata. Two of six purportedly related genera were not closely related to Eutrema. Both analyses placed Lignariella within a separate well-supported clade with Aphragmus, while the other four genera, Neomartinella, Platycraspedum, Taphrospermum, and Thellungiella, fell within a well-supported clade with Eutrema. Morphology and molecular data strongly suggest transferring Arabis arenicola to Arabidopsis, expanding Aphragmus to include Lignariella, and expanding Eutrema to include Neomartinella, Platycraspedum, Taphrospermum, and Thellungiella. New combinations in Arabidopsis and Aphragmus are proposed.

Les auteurs ont utilisé les données de séquençage de la région nucléique et ribosomal de l’espaceur transcrit interne (ITS) de 45 taxons, pour déterminer les relations phylogénétiques des genres Arabis, Arabidopsis, Braya et Eutrema et de celles du genre Eutrema avec les genres présumément reliés Aphragmus, Lignariella, Neomartinella, Platycraspedum, Taphrospermum et Thellungiella. L’Arabis arenicola a été décrit au départ comme un Eutrema en 1830, avant d’être transféré à Arabis en 1898, et est demeuré un Arabis jusqu’à maintenant, même si sa morphologie le rapproche plus des Arabidopsis, Braya et Eutrema. Les auteurs ont obtenu des données de séquençage à partir de taxons représentatifs d’Arabis, Arabidopsis et Boechera et Catolobus reliés, Braya et Neotorularia, et Eutrema, Aphragmus, Lignariella, Neomartinella, Platycraspedum, Taphrospermum, et Thellungiella. Les cinq accessions de l’Arabis arenicola examinées ont des séquences ITS identiques les unes avec les autres et avec quatre accessions de l’Arabidopsis hyata. Dans les analyses de parcimonie maximale aussi bien que de parenté maximale l’Arabis arenicola se retrouve dans le clade des Arabidopsis et est étroitement aligné avec l’Arabidopsis lyrata. Deux des six genres présumés comme reliés ne sont pas reliés aux Eutrema. Les deux analyses situent les Lignariella à l’intérieur du clade bien supporté des Aphragmus, alors que les quatre autres genres Neomartinella, Platycraspedum, Taphrospermum et Thellungiella se retrouvent dans le clade bien supporté des Eutrema. Les données morphologiques et moléculaires suggèrent fortement de transférer l’Arabis arenicola au genre Arabidopsis, d’étendre le genre Aphragmus pour inclure les Lignariella et d’étendre les Eutrema pour inclure les Neomartinella, Platycraspedum, Taphrospermum et Thellungiella. Les auteurs proposent de nouvelles combinaisons dans les genres Arabidopsis et Aphragmus.

Document Type: Research Article

Publication date: February 1, 2006

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