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Free Content Aetiology of community-acquired pneumonia in hospitalized adult patients in New Caledonia

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Summary Objective  To describe the aetiology of community-acquired pneumonia (CAP) in hospitalized adult patients in New Caledonia, a French archipelago in the South Pacific. Methods  Confirmed CAP patients ( = 137) were enrolled prospectively. Pathogens were detected by culture, molecular methods, serology on paired sera, immunofluorescence on nasopharyngeal swabs and antigen detection in urine. Results  The aetiology of CAP was determined in 82 of 137 cases (59.8%), of which 31 exhibited two or more pathogens (37.8%). Hundred and seventeen pathogens were detected: was the most common one (41.0%), followed by influenza virus A (22.1%) and (10.2%). The frequency of atypical bacteria was low (6.0%). The most frequent and significant coinfection was with influenza A virus ( = 0.004). Influenza virus was detected from nasopharyngeal swabs in four patients (15.4% of patients tested for influenza) and by PCR from pulmonary specimens in 15 patients (57.7%). Conclusions  is the leading cause of CAP in New Caledonian adults. Viral–bacterial co-infections involving and influenza virus are very common during the winter. Such adult patients hospitalized with CAP are a clear sentinel group for surveillance of influenza. Vaccination against influenza and should be strengthened when risk factors are identified.

Etiologie de la pneumonie communautaire chez les patients adultes hospitalisés en Nouvelle-Calédonie  Objectif: 

Décrire l’étiologie de la pneumonie communautaire (PC) chez les patients adultes hospitalisés en Nouvelle-Calédonie, un archipel français dans le sud du Pacifique. Méthodes: 

Les patients confirmés PC (n = 137) ont été recrutés de façon prospective. Les agents pathogènes ont été détectés par culture, méthodes moléculaires, sérologie sur des paires de sérums, immunofluorescence sur des prélèvements du nasopharynx et détection d’antigène dans les urines. Résultats: 

L’étiologie de la PC a été déterminée chez 82 des 137 cas (59,8%) dont 31 présentaient deux ou plusieurs agents pathogènes (37,8%). 117 agents pathogènes ont été détectés: Streptococcus pneumoniaeétait le plus courant (41,0%), suivi par le virus influenza A (22,1%) et Haemophilus influenzae (10,2%). La fréquence des bactéries atypiques était faible (6,0%). La coinfection la plus fréquente et importante était celle avec S. pneumoniae et le virus de l’influenza A (p = 0,004). Le virus de l’influenza a été détecté dans des prélèvements nasopharyngés chez 4 patients (15,4% des patients testés pour l’influenza) et par PCR à partir de prélèvements pulmonaires chez 15 patients (57,7%). Conclusions: 

S. pneumoniae est la principale cause de PC chez les adultes de Nouvelle-Calédonie. Les coinfections viro-bactériennes impliquant S. pneumoniae et le virus de l’influenza sont très fréquentes pendant l’hiver. De tels patients adultes hospitalisés avec une PC sont un groupe sentinelle claire pour la surveillance de l’influenza. La vaccination contre l’influenza et S. pneumoniae devrait être renforcée lorsque les facteurs de risque sont identifiés. Mots-clés: 

étiologie, pneumonie communautaire, Nouvelle-Calédonie, virus influenza, PCR.

Keywords: New Caledonia; PCR; aetiology; community-acquired pneumonia; influenza virus

Document Type: Research Article


Affiliations: 1:  Institut Pasteur de Nouvelle-Calédonie, Nouméa, New Caledonia 2:  Service de Pneumologie, CHT Gaston Bourret, Nouméa, New Caledonia

Publication date: December 1, 2010


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