Free Content Subtype prevalence, plasmid profiles and growing fluoroquinolone resistance in Shigella from Kolkata, India (2001–2007): a hospital-based study

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Abstract:

Summary Objectives  Shigellosis is a major public health problem, and increasing antimicrobial resistance has complicated its treatment. We report isolation frequency, plasmid profiles and antimicrobial resistance of subtypes in Kolkata, India, from a prospective hospital-based study. Methods  Fresh stool or rectal swabs were collected from children (<5 years) attending the Diarrhea Treatment Unit of a governmental paediatric referral hospital in Kolkata. Samples were processed following standard methods over a 7-year period from January 2001 to December 2007. Results  Of 4478 samples collected, 516 (11.5%) were positive for spp. (312; 6.9%) was the most frequently isolated serogroup, ranking before (123, 2.7%), (48, 1.1%) and (33, 0.7%). Although 10 subtypes of were identified, the common ones circulating locally were 2a (179), 6 (38) and 3a (36). Knowledge of subtypes is important for vaccine development. The majority of isolates (81.0%) were multidrug (two or more antimicrobial classes) resistant and showed high minimum inhibitory concentration (MIC) with commonly used drugs like ampicillin, tetracycline, co-trimoxazole and nalidixic acid. Emergence of fluoroquinolone (FQ)-resistant type 1 (100.0%) in 2002–2003 was followed by frequent isolation (>25.0%) of FQ-resistant 2a, and 3a in 2004, which restricted use of fluoroquinolones for treatment. A number of smaller plasmids (<20 kb) with distinct patterns have been observed for several years in predominant subtypes. Conclusion  Long-term surveillance of and their antimicrobial resistance are mandatory in endemic areas to formulate treatment policy until any suitable candidate vaccine is available to control the disease.

French
Prévalence des sous-types, profils plasmidiques et augmentation de la résistance de Shigella aux fluoroquinolones à Kolkata, en Inde (2001-2007): une étude en milieu hospitalier Objectifs: 

La shigellose est un problème majeur de santé publique et la résistance croissante aux antimicrobiens a compliqué son traitement. Nous rapportons la fréquence des isolements, les profils plasmidiques et la résistance aux antimicrobiens des sous-types Shigellaà Kolkata, en Inde dans une étude prospective basée sur l’hôpital. Méthodes: 

Des échantillons de selles fraîches ou des frottis rectaux ont été recueillis chez des enfants (<5 ans) fréquentant l’unité de traitement de la diarrhée d’un hôpital de référence pédiatrique gouvernemental à Kolkata. Les échantillons ont été traités suivant des méthodes standards sur une période de 7 ans, de janvier 2001 à décembre 2007. Résultats: 

Sur 4478 échantillons prélevés, 516 (11,5%) étaient positifs pour Shigella spp; S. flexneri (312; 6,9%) était le sérogroupe le plus fréquemment isolé, se classant devant S. sonnei (123, 2,7%), S. dysenteriae (48; 1,1%) et S. boydii (33; 0,7%). Bien que 10 sous-types de S. flexneri ont été identifiés, les plus courant circulant localement étaient S. flexneri 2a (179), S. flexneri 6 (38) et S. flexneri 3a (36). La connaissance des sous-types de Shigella est importante pour le développement de vaccins. La majorité des isolats de Shigella (81,0%) étaient multirésistants (à 2 ou plusieurs classes d’antimicrobiens) et montraient une CMI élevée pour des médicaments couramment utilisés tels que l’ampicilline, la tétracycline, le co-trimoxazole et l’acide nalidixique. L’émergence de S. dysenteriae de type 1 résistant aux fluoroquinolones (FQ) en 2002-2003 a été suivie par l’isolement plus fréquemment (> 25,0%) de S. flexneri 2a, 3a résistants aux FQ et la restriction de l’utilisation des médicaments. Un certain nombre de petits plasmides (<20Kb) avec des profils distincts ont été observés depuis plusieurs années dans les sous-types prédominants. Conclusion: 

La surveillance à long terme des Shigella et leur résistance aux antimicrobiens sont obligatoires dans les zones endémiques afin de pouvoir formuler une politique de traitement jusqu’à ce qu’un vaccin candidat approprié soit disponible pour lutter contre la maladie. Mots-clés: 

Shigella, sous-types, résistance aux antimicrobiens, fluoroquinolone, plasmide

Keywords: Shigella; antimicrobial resistance; fluoroquinolone; plasmid; subtypes

Document Type: Research Article

DOI: http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-3156.2010.02656.x

Affiliations: 1:  Bacteriology Division, National Institute of Cholera and Enteric Diseases, Kolkata, India 2:  Clinical Division, National Institute of Cholera and Enteric Diseases, Kolkata, India 3:  Data Management Division, National Institute of Cholera and Enteric Diseases, Kolkata, India

Publication date: December 1, 2010

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