Free Content Phylogeny of dengue virus type 3 circulating in Colombia between 2001 and 2007

Authors: Villabona-Arenas, Christian Julián; Miranda-Esquivel, Daniel Rafael1; Jimenez, Raquel Elvira Ocazionez2

Source: Tropical Medicine & International Health, Volume 14, Number 10, October 2009 , pp. 1241-1250(10)

Publisher: Wiley-Blackwell

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Abstract:

Summary

Dengue virus type 3 (DENV-3) re-appeared in Colombia in 2001 after 23 years of apparent absence, in the state of Santander in the North-eastern region near to Venezuelan border. In 2002, the virus was isolated in the state of Valle del Cauca in the South-east region near to Ecuadorian/Peruvian border, and in the state of Antioquia in the North-east region near to Panama border. To gain insight into the molecular epidemiology of DENV-3 in Colombia, we sequenced the complete E gene of 21 isolates sampled in the period 2001-2007. Phylogenetic analyses revealed that Colombian strains seem to have been introduced from Venezuela, Ecuador and Peru, but not from Brazil, Argentina, Paraguay or Central America countries. This study also confirms previous report showing that Colombian isolates is closely related to DENV-3 genotype III.

French
Le virus de type 3 de la dengue (DENV-3) a réapparu en Colombie en 2001, après 23 années d'absence apparente, dans l'Etat de Santander dans la région du nord-est près de la frontière vénézuélienne. En 2002, le virus a été isolé dans l'état de Valle del Cauca, dans la région du sud-est près de la frontière avec l'Équateur et le Pérou et dans l'État d'Antioquia, dans la région du nord-est près de la frontière du Panama. Afin de mieux comprendre l'épidémiologie moléculaire du DENV-3 en Colombie, nous avons séquencé l'entièreté du gène E de 21 isolats collectés au cours de la période 2001-2007. Des analyses phylogénétiques ont révélé que les souches colombiennes semblaient avoir été introduites à partir du Venezuela, de l'Équateur et du Pérou, mais pas du Brésil, de l'Argentine, du Paraguay ou des pays d'Amérique centrale. Cette étude confirme également des rapports précédents montrant que les isolats de la Colombie sont étroitement liés au DENV-3 de génotype III.

Keywords: dengue virus type 3; re-emergence; Colombia; phylogenetic analysis; virus de la dengue de type 3; ré-émergence; Colombie; analyse phylogénétique; virus del dengue tipo 3; re-emergencia; Colombia; análisis filogenético

Document Type: Research article

DOI: http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-3156.2009.02339.x

Affiliations: 1:  Laboratorio de Sistemática & Biogeografía, Escuela de Biología, Universidad Industrial de Santander, Colombia 2:  Laboratorio de Arbovirus, Centro de Investigaciones en Enfermedades Tropicales, Universidad Industrial de Santander, Colombia

Publication date: 2009-10-01

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