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Free Content A systematic review and meta-analysis of molecular epidemiological studies of tuberculosis: development of a new tool to aid interpretation

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Abstract:

Summary Objectives  The proportion of tuberculosis cases in a population that are clustered (i.e. share identical strains of ) reflects ongoing transmission. It varies markedly, but it is unclear how much of this variation reflects measurable differences in study design, setting and the patient population. We aimed to assess the relative impact of these factors and develop a tool to improve interpretation of the proportion clustered from an individual study. Methods  We systematically reviewed all population-based TB clustering studies that used IS6110 RFLP as their main DNA fingerprinting technique. Meta-regression was used to see how much of the variation in the proportion clustered between studies could be explained by variables describing study design, setting and population. We compared expected clustering, based on study design and setting, with that observed. Results  Forty-six studies were included. Just four factors related to study design and setting–study duration, sampling fraction, handling of low band strains and tuberculosis incidence–explained 28% of the variation in the proportion clustered. Additionally including average patient age and proportion foreign born explained 60% of the variation in clustering for industrialized countries. Comparison of expected and observed proportions showed that for some studies the expected proportion clustered differed strongly from that observed. Conclusions  We were able to account for much of the variation in the proportion clustered. The comparison of expected and observed clustering allows for a more valid comparison of studies and provides a tool for identifying outliers that warrant further investigation.

French
Revue systématique et méta-analyse des études d’épidémiologie moléculaire sur la tuberculose: développement d’un nouvel outil d’aide à l’interprétation Objectifs: 

La proportion de cas de tuberculose (TB) qui sont regroupés dans une population (i.e. par groupes qui partagent des souches identiques de M. tuberculosis), reflète une transmission en cours. Elle varie de façon importante, mais il n’est pas clair dans quelle mesure cette variation reflète des différences mesurables dans la conception des études, l’endroit et la population de patients. Nous avions pour but d’évaluer l’impact relatif de ces facteurs et de développer un outil pour améliorer l’interprétation des proportions groupées dans une étude donnée. Méthodes: 

Nous avons passé en revue systématiquement l’ensemble des études de populations sur le regroupement de la TB, basées sur le RFLP IS6110 comme principale technique d’établissement de l’empreinte génétique de l’ADN. Une méta-régression a été utilisée pour voir à quel point la variation dans des proportions regroupées entre les études pourrait être expliquée par des variables décrivant le concept de l’étude, l’endroit et la population. Nous avons comparé les regroupements attendus à ceux observés, basés sur la conception de l’étude et l’endroit. Résultats: 

46 études ont été incluses. 4 facteurs seuls, liés à la conception de l’étude et l’endroit - durée de l’étude, fraction d’échantillonnage, manipulation de souches à faible nombre de bandes IS et incidence de TB - expliquaient 28% de la variation dans la proportion regroupée. En outre, l’inclusion de l’âge moyen des patients et la proportion de ceux nés à l’étranger, expliquait de 60% de la variation dans le regroupement pour les pays industrialisés. La comparaison des proportions attendues et observées a montré que, pour certaines études, la proportion attendue différait fortement de celle observée. Conclusions: 

Nous avons été capables de définir la plus grande partie de la variation dans la proportion regroupée. La comparaison du regroupement attendu à celui observé permet d’obtenir une comparaison plus valide des études et fournit un outil permettant d’identifier les points atypiques justifiant une investigation supplémentaire.

Keywords: Tuberculosis; clustering; cohort study; epidemiology; epidemiología; estudio de cohortes; evaluación de sistemas de salud; health systems evaluation; revisión sistemática; revue systématique; systematic review; tuberculose; tuberculosis; épidémiologie; étude de cohorte; évaluation des systèmes de santé

Document Type: Research Article

DOI: http://dx.doi.org/10.1111/j.1365-3156.2009.02316.x

Publication date: August 1, 2009

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