Free Content Polymorphisms in HIV-1 subtype C proteases and the potential impact on protease inhibitors

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Abstract:

Summary Objectives  (i) To review data on the genetic profile of the protease (PR) gene of human immunodeficiency virus (HIV)-1-C primary isolates relative to HIV-1-B; (ii) to examine data on the susceptibility of HIV-1-C isolates harbouring polymorphisms to PR inhibitors (PI) and the development of resistance; and (iii) to identify gaps required for an improved understanding of the role of polymorphisms in resistance development of HIV-1-C to PI. Method  Literature review. Results  Significant differences exist between the baseline nucleotide and amino acid sequences of PR of HIV-1-B and HIV-1-C. Some of the amino acid substitutions seen in HIV-1-B when exposed to PI occur naturally in HIV-1-C isolates. Studies used different methodologies and interpretation systems to evaluate the phenotypic significance of polymorphisms seen in subtype C viruses, with conflicting outcomes. The evolutionary path to the resistance of HIV-1-C to PI may be different from that of HIV-1-B. Conclusions  Infection with HIV-1-C is driving the AIDS epidemic in regions of the world with the most urgent needs for the management of the disease. More and more individuals will require PR inhibitors in second-line therapies, as access to antiretrovirals progresses. It is proposed that a standardized protocol be adopted to evaluate the phenotypic significance of the highly polymorphic HIV-1-C PR to PR inhibitors with the aim of better informing the tailoring of treatment regimens for optimal clinical benefit.

French
Objectifs 

(1) Revue des données sur le profil génétique des gènes de protéase d’isolats primaires du VIH-1-C par rapport à ceux du VIH-1-B, (2) examiner les données sur la sensibilité d’isolats du VIH-1-C avec les polymorphismes d’inhibiteurs de protéase et le développement de résistance et (3) identifier les informations manquantes pour une amélioration de la compréhension du rôle des polymorphismes dans le développement de la résistance du VIH-1-C aux inhibiteurs de protéases (IP). Méthode 

Revue de littérature. Résultats 

Des différences significatives existent entre les nucléotides et acides aminés initiaux du VIH-1-B et VIH-1-C. Certaines substitutions d’acides aminés observées dans le VIH-1-B exposé aux IP surviennent naturellement dans les isolats de VIH-1-C. Des études basées sur des méthodologies et systèmes d’interprétation pour évaluer la signification des polymorphismes phénotypiques rencontrés dans le sous-type C du virus, ont trouvé des résultats conflictuels. L’évolution vers la résistance du VIH-1-C aux IP pourrait être différente de celle du VIH-1-B. Conclusions 

L’infection par le VIH-1-C est le moteur de l’épidémie de SIDA dans les régions du monde où un besoin urgent pour la prise en charge de la maladie existe. Avec la progression de l’accès aux antirétroviraux, de plus en plus de personnes auront besoin d’inhibiteurs de protéase en traitement de seconde ligne. Nous proposons qu’un protocole standardisé soit adopté pour évaluer l’importance du phénotype du très polymorphe protéase du VIH-1-C vis à vis des inhibiteurs de protéase, dans le but de mieux informer sur l’adaptation des régimes de traitement pour des bénéfices cliniques optimaux.
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